Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00961910Standard Name
RRP5 (rRNA processing protein 5)Aliases
PreTt23679 | 178.m00060Description
RRP5 S1 RNA-binding domain protein; pre-rRNA processing protein RRP5Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF00467 ) KOW motif
- ( PF00575 ) S1 RNA binding domain
- ( PF01535 ) PPR repeat
- ( PF05843 ) Suppressor of forked protein (Suf)
- ( TIGR00179 ) UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase
- ( TIGR00717 ) ribosomal protein S1
- ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
- ( TIGR01612 ) rhoptry protein
- ( TIGR02063 ) ribonuclease R
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_15853.1 9.997093137033517e-262 Description: S1 RNA binding domain-containing protein (2056 aa) Tetrahymena borealis EI9_18806.1 9.997093137033517e-262 Description: FHA domain-containing protein (680 aa) Oxytricha Contig5641.0.g70 9.997105718980434e-168 Description: S1 RNA binding domain SGD YMR229C 5.001636743996964e-56 Description: RRP5 RNA binding protein with preference for single stranded tracts of Us involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs; component of both the ribosomal small subunit (SSU) processosome and the 90S preribosome DictyBase DDB_G0290181 8.003186242472315e-51 Description: DDB_G0290181 on chromosome: 5 position 3746723 to 3749553 WormBase WBGene00002850 7.003455847728069e-40 Description: locus:let-716 status:Partially_confirmed UniProt:Q18038 protein_id:CCD63223.1 WormBase WBGene00003858 7.003455847728069e-40 Description: locus:ogt-1 status:Confirmed UniProt:Q2L6Y4 protein_id:CCD61615.1 Stentor Coeruleus SteCoe_32870 0.000000000013887943864964021 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00961910(coding)
ATGGCTCCTATAAATAATAAATCATAATAAAAGGGTAAACCACACCCAGCTAAGGGCGGT
AGATAAAATCAATAAGACAAGCCCAAAAGAAAAGTTCCAGCTTGGGAAAACAAATTTAAA
GATGAAATAGTAGATTATTTTGATGGTGCTCAAGACGCAGATGGTGAGCAAATGTTTAAT
AAAATGCCCATTCTTAAGGAAAACAACAGGGTTATGAAGCCATCCAAGAAAGCAAAAAAT
TTAAAATAAAAGAGTGACATTATAAATTCAGATGACGAGTTTGAAAGAATGATGATGGGA
GGTTAGTCTAAAAAATTAAAATCTGCTGACGACGACATTTTCGGAGGAGAATCAGGCTTA
TTCACTGCTGGTGAATAGTCTTTCAGCAATTTCTTTATTTAAAATAAATATGCTTTACTT
CAACTTGAAAAAGTCCCAGTCCTTAGATATTCTCCTGGAACTTAAGTTTTAACTGCTGTC
AGCGAATATGGTTCAAACGGACAATATATGGTTGTTAACTTATCAAGAAATAAAAAGGCT
TTCGTCACTGTTGCTGATGCTACAGAAGCAAGCAAGGAAGAAAATGATTTAAGAATTTAT
GATTAAGGTGAATATTTGATTGGTGAAATAGTTCCTAGCATTAAGGAAGGAAACATGAAT
GTTTCAATTAAGACTTCTAAGGTCAATAGCGGACTTTAAATTAGCGATATTCATTTAAAT
ATGATTTTACCAGGTCTTGTTTCAAGCAAAGAAGACCACGGTGCCAAGATTGAATTCAAT
GGAGGCGAGAAGTACTTTGGCTTTTTATCAAAAGATGAAGCTAATAACTTTGAGGATTTA
GAAGAAGGTAGAGTTTATATGTTCAGAGTTATTAAGAAAGAAGAAAAGAAGAGATTAGTT
CATTTAAGTCAAAAGGTTTCTGATTAGGAAGGAAAGTTTGTTGTTAGCGGCGAAGTTGAC
ATTGAAGATGGTGCCGATTTACATCACTTAGCTAAGCCTGGTAACCTTGTCAATGCTGTC
ATTTTAAAGGTTTTGAACAATGGTTTGATTGTTAGATTCCTCAAATAGTTTATTGGTTTT
ATTTTCGAAGATCATCTTGACAAGGAAATCTCGGCTTACAAAGAGAAAGAAAAGCTTTTA
GCAAGAATTATAGCATCTGATTTCGACCAAAAGCAAATCAATTTATCAGTTAAAAAAGCT
CATATTGACTTAAAGCCCTATGAAGATAATTCAATCGTTACTGGTGATGTTCTCACTGAT
GGCTTCGTAGTTACTAAAGCTTTATACGGTGGCTCTTATTTCGTTAAGCCAAATAATTCT
AATATTTAATAATCATTCTTGCACAAGGCTCACATTGAAAAAGAAGAATTGAAAGAAGGT
TAAACCTACACTGATGCAATTAAAATCAAAGAAATTAATTATTTCGAATAAATTCCCATT
ATCACTGCTAAGGGAGAATTAGTTAAGCGTGTAACAAACTGGAATGATCTAAGACCAGGC
ATGCAACTTAGTGCAAAAATCGATAAGATCATTTAAGGAGCCAATAATTAATATAAATTG
AAAGTAGCAGTTAATGATAAAATGATAGGTTTAGTTGATTTTTACAATACTGCTGATATT
CCCAAAGCTGGTCCTGTTCCTAAAAACTTGAAGGAAGGTAGAAAAATTAAGGTTAGAATT
ATGAGTGTTAATCCTTCTGATAAGACTCTTCGTTTTACCATCAAGCCTGCATTATTGAAT
GAAGAAGATGACAAAATTCTTAAAAATATCTCCAATGCCCAAGTCGGCGACTCCTACTTA
GGTTTTATCTCCAGAAAAACTGAATATGGCTATATAGTTTAATTCTTTGGCGATGTCATT
GGTTTACTCACTTTTAAGGACATAGAAGAAATTAACGGACACAGTCGTGATGAATACAAA
GTTGGTTAAGTTATTAGAGTTTATATTGCCTTTGTTAATGCTGAATAAGGAAAGATTGGT
CTCTCCATTTCTGAAAAAGGAGTTTCTCAATTATAAAAATAAAAGCTTTCATAGAACACC
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AATGTTGGAGATGTTTTGGAATATATTGTCGAAAACAATCAAGCTCTCTAAGACGTTTTG
ACTCTTTACCACAAGGAACACAGAGCCATTATTGCTATTGAGCACTTATCAGACTTTAGA
AATCACTACTAATCTCTCAACTAATACTACAGAACTCTTCCTAACAAGGGTAATCAAGTA
ACAATTAAATGTAAAATTATTCATATCATGCCAAACAAGAATGTTATTGTCTCTGCTAAG
CCTAGCATTTTGAGCAATATGAATCCCAATTCTTTAGAAAGTGTTAAGGCTAATAATATC
TACACTGCTTACATTGATAGAGGTGCCCGTAAAGGTGTCTTGGTTAAGTTCAATGAAAGA
GTTAAATTTTTCATTGGTAAGGAAAATTTGGATGAACACGCTGCATTCCAAACTTACGAC
AGTGTTTTAGTTTTTGTTAAAAATGTTGAAGGTGATAAAATCACTGCAAGCTTATAAAAT
GAAGCTGTTTTCAAGAAACAAGCCCACATTAACAGCTAATTCAACAGATTCATTGAATAT
TTTAATGACGAATACATGTTAAACAAGAAATTCACTTAAGGTGAACACAAAAAAACATGG
AATAAATATAGAGTTGGTAACTACGTAAACACTACCATTGAACTTGTCAAAGAATTCGGT
ATTGTAGTTAAAGTTAACGATTCACCTTTAACAGGTTTAATTATGAACGAGCACGTTGCT
AACACTAGAAGCACTTTGGCTGAAGGTCAAACTCTCCTTTGCAGAATCACAGACATTGAT
TTCGAAAAGCAAATGGTTGATGTTATTCCTAGTCCCATTGATGATAATACCAAGTTGACC
ACTCTCTTACAAAGCAACAACTTCAACTTAGACAAATTCCTTGAATTAGAAAATAACGAA
ACTATTGATGCAACTGTCATTTGCTAGAAGGGCGAATACATTATTTGCTAGATCACCAAG
GCTCCTAAAGTTTTTTGCTACGTTAACATGACTAACTTTAATAATCTTGAACACGAAGAA
ATGCTTTTCGGATAAAAAATCAAAAACCTTAAGTGTGTTAACAAAGAAATATTACAAAAG
ACTCATAAGAATGCTTAATCTACCAATATGGCTTTAAGAAGCAACTATATTCCTTTATTC
GAATAATAGGTTAACTAACAAAATAAAGGAACAGCTATCGAAGAAAAGAGCGGAATTACT
CTTAAACCTGGTATTAAGGTTGTTGGTAAAGTCCTTAAGACTGTTGGCTTCAATGTCTTT
GTTTAACTCAAGGGTAAACTTTATGGAAAATTACATAAATCATAATGCCAAGATGCTGAA
TAATTTGCTTCTTTTAAGGAAGGCTAACAAATTGATTGCAAGATTCTCTATCTTAAGAAA
GACAAATCTCTATAGATTGATTTAACTACTAAGTAGGCTCACATGAATAGCACATTACTT
GAAGAAAGTGAAGTTTTATCTATGAGCATTGATAATTTCAGAGAAAACTGTGTTGGTTAA
ATTCACCGTGGTGTTGTAAAAAGCACAGATCCTTCTTCAATTCACCCTGTTTACATTGAA
TTATCCAACTATCATCATGGTTACTTCAGCGCTTTCGATCTCGACGCTGAAGATCTTAAC
TAAATTAAGAAGAAATACAAAAAGGGCTCCATAGTTGAATGCAGAATTGTTTCTTTATCT
TCATCCAAAGAAAACGATCTCAAGCACATCTAACTTTCTCCTAAGTTATTGTCTGCTGAT
GAATCTGCTGAAAAGAAAGACTCTATCAAGGTTGGAGATCTCGTCACAGCTAAGATTGTT
AAGAAAAACAACAATGGTTTCCGTGTTCAAATCAGCGATAATCTCTTCGGAAATGTTGAT
ATTACTGAAATCTGCGATGAATGGATTGCTAATGCCTCTTCTTCCATTCAAATAAACTCT
TTTGTTAAGGCTAGAGTTATTGCTGAAGAAGGTGATCACAAATATCTTTCTCTCCGTTCT
TCAGTTACTAATGAATAAAACTGGAAAAACTCTTTAGGTCCCAATGGAACCACTATTAAC
TACAAAAAGTACTTCTCCGATAGCGAAAAGATTGGAGATCTCAGAAATAGAATTATTAAA
CTCGGTCCTGGTTCTATTAAGGTCGGTATGGTATTTGTTGGTTACATCAACTAAACTAAC
GATAAGGGTTGCTTTATTAAGATTGGTTAAGACACTGTTGTTAGAGCAAGCTTGAACGAA
TTAAGCGATGAACATATTGCTAAGCCTTAAACTCATTTCTACCAAAATAAGCTTGTTGTT
GGTAGAATCATTTAAATTAAGGAAGATGGTAAAATTGAAGCTTCTCTTCGTGAATCTGTT
ATTAAATACGGTTACTCCATGGATGACAGCAAATTATAAGTTGGTGCTACCGTCTATGGT
ACTGTCGTTGGTCACTACTAAGGCAGAGCTTCCGTTTCAATAAGAGGATGCAAGTTTAGA
GCTTCTCTTGATAAGGATGACACTGATTTCACCGATGAAGAAAAAATGGGTTATGTTGAA
AAACTTCTCCCTATTGGTTCTGCAGTGAAGGCTAAGGTTATTAAGTACGAAAAGGAGCCT
AAGGTCAAGATTATTTTGAGCACTGAAAAGCTCGTCTTTGATAAGTACAGCAACGTTGAA
GAAGCTGAAAAGGAAGAAAGTGAATAAAGCCATTTGGATCTCCTTATCAAATCCGTAGAT
GAAATCAATGTCACTGCAAAGGTTGCTGATGAAAAGACAACTGAAATTAAAATTACTAAA
AACTATGCTCTTAACCAAGAAAATAAAACTGAATAAGATGAAGAAAAAATGGAAGAGGAA
GACGAAGAATAGGAAGATGATGAAGACAACAAATCCGATTTAGATGAAGATGAAATATAA
AATCTTATTGCTAATTAAGGAGTAGAATTCGAAGGATTTGAAGGTAACGAAGAAGCTGGT
GATGATGATGAAGGTGAAGATGATGAAAGCATTTTGAGTGAACAAAGTTTACTCGATGAA
GAATTCGGTGAAGAAGACATCATCTCTAACAAGAAGAAATCAAGAAGATAAAAAGAAATC
ATCAAGCGTAAAAAAGAAGAAGAAATCAGAGAATAAGAAAAGAAATTGATTGATGAAAAC
GCTTAACCCGAAAACAGAGATGACTACGAAAAACTCATCTTGAAGAATCCTAATAGTTCT
TATGTTTGGATTTAATTCATTGCTTTCGTCATTGAAAAGGAAGGAATTCAAGCTGCTCGT
GAAGTCACCGAAAGAGCTCTTAGAGTTATTAATTTCAAGAATGAAAATGAAAAATTAAAC
ATTTGGACTGCTTATCTCAACTTAGAACACAACTTTGGTGAAGAAAAGGCTCTAGTTAAG
GTTTTCGAAAGAGCTAAAGCTTCTTGCAAGCCCAAAGACGTCTACTTCAAGTTACTTGAA
ATCTACAGAAGAGATTCTAGCAAATACGAATTACTCTTCCAACTTTCAAAGAATATGGTC
ACTAAATTTAAACACTCAAGCAAGTGCTGGATTGAACACGTTAAAAATGTCATTTTATAC
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GAAGTTTTAAAGAGAGCTTTGATTTGCTTAAAGAAGAAGAAACACATTATTGTCCTTTCT
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GCTGTTGTAGCCAACTATCCTAAGAGAACTGATATCTGGAATGTTTACATCGATATGGAA
ATGAAGTATGGTACCTTAGAAAGCGCTAGAAACTTATTTGAACGTGTCATAACTATGTAA
TTCAAGCCCAGATAAATGAAATTCTTCTTCAAGAAATATCTCCAATTCGAAGCTACCAAA
GGAACTACTGAAAGAGTTGAAGAAGTTAAATAAAAGGCTGCTGAATACGTCCAATCTCTT
ATTGGTTAAGATGAAGATAACGAACAAGAAGAAGAATAAAATGAAATGGATGTTGAAGAA
TAAAATGGTGATGAAGAAATTGAAAATATAGATGATGACATCGAAGACGAAGACGATGAA
TGA>TTHERM_00961910(gene)
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GATGAAATAGTAGATTATTTTGATGGTGCTCAAGACGCAGATGGTGAGCAAATGTTTAAT
AAAATGCCCATTCTTAAGGAAAACAACAGGGTTATGAAGCCATCCAAGAAAGCAAAAAAT
TTAAAATAAAAGAGTGACATTATAAATTCAGATGACGAGTTTGAAAGAATGATGATGGGA
GGTTAGTCTAAAAAATTAAAATCTGCTGACGACGACATTTTCGGAGGAGAATCAGGCTTA
TTCACTGCTGGTGAATAGTCTTTCAGCAATTTCTTTATTTAAAATAAATATGCTTTACTT
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ATTTTTCAAAATCAAAACTTACTCATTTCTACTTGTTTAAATAATAGAGATATTCTCCTG
GAACTTAAGTTTTAACTGCTGTCAGCGAATATGGTTCAAACGGACAATATATGGTTGTTA
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TTTATCTTATTTTTATGATAATTTTTTTAAAAAAATCGAATAGTTCTTGAATTTGCTGCA
TCTTCTACTTATTTGCAAAACAAAATAGGTCATGATGAATAACTATCATTTATCTATTAT
TGAATCAAAAATTTATATAAAATGCAACAGATTGAAATAGCTATTTCGTTTATTTAAAGA
TTTTAATATGAACAAAAATTTAAAGATTATACTTTTGTTCAATATTTAATTTAAATTTAT
TCATATAAAATTAGAGCAAGGAAGAAAATGATTTAAGAATTTATGATTAAGGTGAATATT
TGATTGGTGAAATAGTTCCTAGCATTAAGGAAGGAAACATGAATGTTTCAATTAAGACTT
CTAAGGTCAATAGCGGACTTTAAATTAGCGATATTCATTTAAATATGATTTTACCAGGTC
TTGTTTCAAGCAAAGAAGACCACGGTGCCAAGATTGAATTCAATGGAGGCGAGAAGTACT
TTGGCTTTTTATCAAAAGATGAAGCTAATAACTTTGAGGATTTAGAAGAAGGTAGAGTTT
ATATGTTCAGAGTTATTAAGAAAGAAGAAAAGAAGAGATTAGTTCATTTAAGTCAAAAGG
TTTCTGATTAGGAAGGAAAGTTTGTTGTTAGCGGCGAAGTTGACATTGAAGATGGTGCCG
ATTTACATCACTTAGCTAAGCCTGGTAACCTTGTCAATGCTGTCATTTTAAAGGTTTTGA
ACAATGGTTTGATTGTTAGATTCCTCAAATAGTTTATTGGTTTTATTTTCGAAGATCATC
TTGACAAGGAAATCTCGGCTTACAAAGAGAAAGAAAAGCTTTTAGCAAGAATTATAGCAT
CTGATTTCGACCAAAAGCAAATCAATTTATCAGTTAAAAAAGCTCATATTGACTTAAAGC
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AAGCTTTATACGGTGGCTCTTATTTCGTTAAGCCAAATAATTCTAATATTTAATAATCAT
TCTTGCACAAGGCTCACATTGAAAAAGTAATTTCTATTTTTTGGAAAAAATTTTAATAAA
TATTTTTCTTAACGAGATTTTTCATAAATAAGCTTTTTTTTTTACAATAAATTAGGAAGA
ATTGAAAGAAGGTTAAACCTACACTGATGCAATTAAAATCAAAGAAATTAATTATTTCGA
ATAAATTCCCATTATCACTGCTAAGGGAGAATTAGTTAAGCGTGTAACAAACTGGAATGA
TCTAAGACCAGGCATGCAACTTAGTGCAAAAATCGATAAGATCATTTAAGGAGCCAATAA
TTAATATAAATTGAAAGTAGCAGTTAATGATAAAATGATAGGTTTAGTTGATTTTTACAA
TACTGCTGATATTCCCAAAGCTGGTCCTGTTCCTAAAAACTTGAAGGAAGGTAGAAAAAT
TAAGGTTAGAATTATGAGTGTTAATCCTTCTGATAAGACTCTTCGTTTTACCATCAAGCC
TGCATTATTGAATGAAGAAGATGACAAAATTCTTAAAAATATCTCCAATGCCCAAGTCGG
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TGATGAATACAAAGTTGGTTAAGTTATTAGAGTTTATATTGCCTTTGTTAATGCTGAATA
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AAATATCTCTCACAATGTTGGAGATGTTTTGGAATATATTGTCGAAAACAATCAAGCTCT
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TCAACTTAGACAAATTCCTTGAATTAGAAGTATTATTATTTCTTATTATAAATCCTTAAA
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TAATTTTTAAAAATTTTTAATTAATAGAATAACGAAACTATTGATGCAACTGTCATTTGC
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GAAGAAGGTGATCACAAATATCTTTCTCTCCGTTCTTCAGTTACTAATGAATAAAACTGG
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GACAGCAAATTATAAGTTGGTGCTACCGTCTATGGTACTGTCGTTGGTCACTACTAAGGC
AGAGCTTCCGTTTCAATAAGAGGATGCAAGTTTAGAGCTTCTCTTGATAAGGATGACACT
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GATGACATCGAAGACGAAGACGATGAATGA>TTHERM_00961910(protein)
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