Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00991550

Standard Name

DRH39 (DExD/H box RNA helicase 39)

Aliases

PreTt07847 | 185.m00068

Description

DRH39 helicase carboxy-terminal domain protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
  • ( PF00097 ) Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF00357 ) Integrin alpha cytoplasmic region
  • ( PF01485 ) IBR domain, a half RING-finger domain
  • ( PF01672 ) Putative plasmid partition protein
  • ( PF04000 ) Sas10/Utp3/C1D family
  • ( PF05377 ) Flagella accessory protein C (FlaC)
  • ( PF07599 ) Protein of unknown function (DUF1563)
  • ( PF07717 ) Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( TIGR01967 ) ATP-dependent helicase HrpA
  • ( TIGR01970 ) ATP-dependent helicase HrpB
  • ( TIGR02300 ) conserved hypothetical protein TIGR02300

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_02917.1 9.997093137033517e-262
Description: helicase domain-containing protein (2060 aa)
WormBase WBGene00012386 9.997093137033517e-262
Description: locus:agef-1 status:Partially_confirmed UniProt:G5EFH7 protein_id:CAA21704.3
Oxytricha Contig12082.0.g38 2.000597631390999e-64
Description: Helicase associated domain (HA2)
DictyBase DDB_G0270110 2.9995010303521745e-64
Description: dhx33 on chromosome: 1 position 4244035 to 4246332
SGD YGL120C 9.004195835458823e-61
Description: PRP43 RNA helicase in the DEAH-box family, functions in both RNA polymerase I and polymerase II transcript metabolism, involved in release of the lariat-intron from the spliceosome
WormBase WBGene00018967 1.0003503620230312e-57
Description: locus:ddx-15 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase F56D2.6 status:Confirmed UniProt:Q20875 protein_id:CCD63138.1
Stentor Coeruleus SteCoe_9095 1.7587922024243116e-25
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00991550(coding)
ATGGATTCAAATTTAAAAGAAAATAATTGTTATATAGTTAATGAGGGCGTAGAAAACGAA
ATGCTCAGTGCTTCATATGTAATATAGAAATTAGAATAGGAATTGATCAATCCATTAAAA
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TACCAAGAAGCCATGCAATCTATTTAAGATTTATTTAAATATTTAAAAAAGCGCTTTTCA
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GGATTTTCCAGTTAGTTAGCCATTTACACGGGAATACATAAGCTAGGATTTTTGAACATT
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AAATAAACAAATAGGGTATTCTAAAAAGGTTAAATACTCTTTTTTTCAGTTTTGGAAGAA
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TAATAAACTATTTAAAATATGAAAGATAAATCCAACTATTAACCATATATCAAGTTGAAT
GGAGAAAGACCATTGTTGGAGTATTTCTCAAGAAATCAGTTTTTAAATATTTAATAATAA
TTAGATAAAATGGATATACCTAAGAAGGCTAAATATTGTGTACTTTTTGAAAAAGATAAA
GGTTATATCCGCTTTTTTTGCAACTAAGAAATGCAGCAATGTATGGACAGCTTAAATATT
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AAGCTCATTCTTCCTCATGAATTCCTTAGAGTTAGTTTAATAGATATCCCATTCAAAAGT
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AAGGAAGTTAAAATCATTAAAGATTACATTAGCTAAACAGCTGTTGCTTTATTTATTTTC
AAGAACACTAAAAAAGCATTTGCTTTTTACGAAGCTTTGACAAAAATGAAGAGAAGTAAA
ATTGCAGAATTGCTGTCAGCAGAGGATAATTAGCTACCGAGAATAGTTCCTTAGCCTGAA
TGCGAATTTTATATAGAATAAATTAAAAATTTATCTAAATCTGTACTAAGAGCTCAATGG
AGTATATGTGAATCACTTTGCTTCGGTAATATGTACTTCAGTAACGAAGTGGATGTCTTG
GCGACCTATGATTAAATGAAAAAAGCCAATTTGTTTAAAGTAAAATACAATATCAAAGAA
GATGCTAACAGTGGAAATTTAATTCATATCTTAGCCTTAGACAAGCTTGATCCTCTTACC
GATGAAATAGATTTATAATCCTATGTTGTTAACACCTACTAAGGTTATTTATCTTGTGAA
ATTAAGAGAGAAATAATCGATCTTTCCATTTAGCATAACATAGACTTGGAAGAAGCTAGG
TAAAAGAGAAATCTTTAAAATTTAATCTAAGACACAATTAACGAATTTAATTTCTTAAAT
ACCAAGCAGAGCGTTAAAAGTTAAAAATTTTAAAAAGGCTAACAAAAATATTAAGAAGCT
AAAGAAAATATATAAATAAAATTAAAAATACACAATGGTGTTTGCAAGGCAGAGATTATG
CTTGACTCTCATGTATATGCTCAAGAGCTTGTCAATAAGTTTGATGGCATTGAATTTGAA
TGCCAAAGGCTTCGTATGTAAATACAAAATTAATAAAAAATTTTGGTTTTGGGTGCTGTT
TACTTATTTTACTATGACAATATTCGCTAGTATATTGATGAGGCAGGATAAAGTGTTCAA
GTCATTGCTCCTAAATACGATAAAGTATTTTATCTATCTAAAACGGTAGAGATTATTACA
AAATAAATTTACTCAAGCTCAAGTTAGATTTTTTAAAAGCTAAACTACTAAATTACCAAT
CTCATTAAACCTGATTTAATTTATTTAAATTGTCTTCCACTTGATCTAGAAAATTTGATG
AATCAGCAAAGTAATATAGTAGAAGGCATGGAAAAATAATACGAATGCATAATCAAGCTA
TCAGGAAAAAGAAGCTCACAGCTTAAAGTTTGGTTTAGAAAGGATAAAACAGGTGATCAA
ATAGCTTCAGAAAAGACGAAAATTAAATAAGTATTTGAGGAATACTTATTCTAAAAATTC
AAATTTAACAAACAAAATTATCATTTTAAATAAGTTGAAGATTATTTACAAAATATGCAA
AAAAAAAATATCATACAAAGCTATGAATAAGATAATAAAAACTTTACAATCACAGCTACA
AAAAGCTAAATTTAAAAAATTTAACAAGAAATTAATGACAAGAATAAAAAATATCTTAAT
AAGTAGAAATCAAAAGTCGAACAACAAGATGATCTTGAGGAGGAAGAAACTTGTTAGATT
TGTTAAGAATTTAAAAATCTTTAAAGATTCTCATGTGAGTGCTTATTTTGTAAAGAATGT
ATCTCTTTATTCTTTTTAACTCAATCCTAACAGTTCCAAAGCACAAAGCCCTTAGCCTGT
CCAAATCACCAAGATTAGCCTGTCAGTATTAAATTAATTGAATCTATTTTAGATCCCCAG
CAATTATAAGAACTCATTTAATTAAGAATTGATCACTCTATTGAGAATATGATTCACCCT
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AATTCAGAAACTTTTGAAGAAATTCCAATATAAAAAAAAGGTTCTAAGATACAAGAGGAG
TTGTCAGCCACCGAAAATTTTGGGATAGCCCCTAGAAGAGTTAAATGCTATGGCTGTTTC
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TAATTTAAAACCTCGAAAGAAGTGTATTAACATTTAGATAAAGAACATCAAGGATATTAC
AATTGA


>TTHERM_00991550(gene)
ATGGATTCAAATTTAAAAGAAAATAATTGTTATATAGTTAATGAGGGCGTAGAAAACGAA
ATGCTCAGTGCTTCATATGTAATATAGAAATTAGAATAGGAATTGATCAATCCATTAAAA
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ATTGATATTTTACTAAATATTGATAAGTAGAGTAATTATAATAATACATAGCATGAAGCT
AATAAAAAGGAAGAACATTAAATTGTTTCAGAAGGAAGTTCAGAGATTTCTGATTCATCA
TAAAATTAAAATCTAAACAATGAATCTAAATACTTAAGTTCACAGAACATATCTTGTTCT
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AATCAAGACTTGGACGTGGATGATGATAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGATGATATTAACACTGTAACTACCTAACCTCTACTTGAAGAGGAGTAAATTGAC
ATTTAAGGGCTTTAGGATAACAAAGAAGTAGAAGAAGAGTAGAAAGTTAATAACGAAATC
TAATAAATAAGTATATAAAAAGGTGATCTTACCTAAAATGCTACAATCGAGGAACTAAAT
AAAGAAGAATATTTGGACAAGACAAATTTATATGAAATTAATAATTTGAATGATTTTTAG
GAATATTTAATTAAGAATATTGAGTAAAATGTTGATTTAAATGAATAAATTCTTCAAAAA
TTAGAGCTTGTTGACAACAAAGAACAAATTAAAAGCTACTTAAACTAAGTTTGCATAACT
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TACTTATTTTACTATGACAATATTCGCTAGTATATTGATGAGGCAGGATAAAGTGTTCAA
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AAAAAAAATATCATACAAAGCTATGAATAAGATAATAAAAACTTTACAATCACAGCTACA
AAAAGCTAAATTTAAAAAATTTAACAAGAAATTAATGACAAGAATAAAAAATATCTTAAT
AAGTAGAAATCAAAAGTCGAACAACAAGATGATCTTGAGGAGGAAGAAACTTGTTAGATT
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AATTGA


>TTHERM_00991550(protein)
MDSNLKENNCYIVNEGVENEMLSASYVIQKLEQELINPLKYFEECTYKDIIKIKSFEQNQ
KQCIPEVKQNFRRCKIFNKDIDILLNIDKQSNYNNTQHEANKKEEHQIVSEGSSEISDSS
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DDDDINTVTTQPLLEEEQIDIQGLQDNKEVEEEQKVNNEIQQISIQKGDLTQNATIEELN
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N