Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01028760

Standard Name

NUP85 (NUclear Pore)

Aliases

PreTt10805 | 204.m00034

Description

Scaffold nuclear pore protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nuclear pore (IEA) | GO:0005643

Biological Process

• transport (IEA) | GO:0006810

Domains

• ( PF00874 ) PRD domain
• ( PF02037 ) SAP domain
• ( PF07719 ) Tetratricopeptide repeat
• ( TIGR00288 ) conserved hypothetical protein TIGR00288

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_10483.1	0.00000000000003999587784428659
	Description: hypothetical protein (171 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834

Sequences

>TTHERM_01028760(coding)
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>TTHERM_01028760(gene)
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TTGTACTCTTATGAAAAACTTGCAGATGCTATTAGTAAGTTAAATAGGGATAATAACTTT
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TCCCAGATAAAGTTGTCATAATAAATTTATAATATTTTAGTGCTCAGAACTTAGTAATTA
ATGAGGGAAATCAAAGAAAACATTATGGAATATGAGTTGTTAAATGATATCTAAAATATT
CAAAGTAAAATTTACAATAAATTATCATTTTATTTAAATTATTTTATAAGTTTATAAATA
GCTAAATCAGGAAATGTAGCACTTTATTTCAATAGTTATGAACAGCTATACATTATGA

>TTHERM_01028760(protein)
MIPENNNLFVNKNSIQNNQNPVLFCWGVDNELFVYDQNNSFNSTKSKKGQAVNLYFSDII
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