Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01030000

Standard Name

SGS1 (Homolog of budding yeast Sgs1 and fission yeast rqh1)

Aliases

PreTt10830 | 204.m00059

Description

SGS1 ATP-dependent DNA helicase RecQ family protein; ATP-dependent DNA helicase- RecQ family protein; Protein involved in DNA joint molecule resolution dHJ dissolution and crossing over

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF01202 ) shikimate kinase
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF06827 ) Zinc finger found in FPG
  • ( PF08839 ) DNA replication factor CDT1 like
  • ( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
  • ( TIGR00643 ) ATP-dependent DNA helicase RecG
  • ( TIGR01389 ) ATP-dependent DNA helicase RecQ
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR03158 ) CRISPR-associated helicase, Cyano-type

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_10497.1 9.997093137033517e-262
Description: ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein (1193 aa)
Oxytricha Contig17511.0.g63 1.999149254372995e-126
Description: DEAD/DEAH box helicase
DictyBase DDB_G0292130 1.9992982665753866e-121
Description: blm on chromosome: 6 position 1240457 to 1244236
SGD YMR190C 1.0002857351297358e-115
Description: SGS1 Nucleolar DNA helicase of the RecQ family; involved in genome integrity maintenance; regulates chromosome synapsis and meiotic joint molecule/crossover formation; potential role as repressor of a subset of rapamycin responsive genes; rapidly lost in response to rapamycin in Rrd1p-dependent manner; similar to human BLM and WRN proteins implicated in Bloom and Werner syndromes
WormBase WBGene00019334 2.999180586171967e-98
Description: Putative ATP-dependent DNA helicase Q1 status:Confirmed UniProt:Q9TXJ8 protein_id:CCD61880.1
Stentor Coeruleus SteCoe_28767 2.572209372642415e-56
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:26519827: Lukaszewicz A, Shodhan A, Loidl J (2015) Exo1 and Mre11 execute meiotic DSB end resection in the protist Tetrahymena. DNA repair 35( ):137-43
  2. Ref:23935123: Lukaszewicz A, Howard-Till RA, Loidl J (2013) Mus81 nuclease and Sgs1 helicase are essential for meiotic recombination in a protist lacking a synaptonemal complex. Nucleic acids research 41(20):9296-309

Sequences 

>TTHERM_01030000(coding)
ATGGATGAAATATTGTAGTAATTTATAGATAGCAAAAGATAAGCAAAGAAGATAGAAGAT
TTTGCAGACGCTGTATCATGCAGTGCCACAGAAAGCTTAGAAGATTAGGACTAATCTTTT
GATAGAGGTGCTGATTTCAACGATGGAGAAGTAGATGATGCTTTATTGGATGAACTTATA
GAATATTAAACAAACAGAGAGCGTTAATCAATTACTGAAGAGTAAAATGATCTCATGAAA
ACTGAATTGTAAAAGCCAATAAGCAACAATTTAAATAAAAAATAACCAACTAGCTTGAGC
GGTTTGCAAAAAGGGTTAGGAAACAAAATATCTGGACCTTCTTATGATTTTAGTAACTCT
AATAATATGTAGACATTAAGCGGCATTTATAGTTCAAATTCTAACAATAACTCTTAGAAC
AGCAATGAGAACTTTAATTTCAATAGACAAGGAAATACTACTCTAAAGCCTACGGGTTTT
GATGCTATCAAGCTTAAAAAAAATTAGAATTAAGATTAATAGTAATAATAATAGCAATAG
CAAGTTCTGAAATTTGTAAATTAAAATAGTAATGGAGGGATTTAAGTAGAGGCTTCTTTA
ACAGATAAAAGAAGATAAGTAAATAACTCTAATGATATTGATAGTTTCATGTTGATCAAT
AACGGATAAAAAGAAAAAAAGACAAAAAATTAAAATTCTAAAATAAGTGAGTTGCTTGAG
AAGTACAAAGTGATAGATTCTAATTCAAATACTTAAAATTTCGAGTCTACTTCGCTTAAT
ACTTCTCTCAATACCAAAAATAATAAATTAGAAGTTAAAAATGGGTTTTAAAATTTACCA
CAAAAAACTGAAAAAATAGGGCTTGCAGCCTAAGCTGTAAATCAAAGCTCTAACGTACGT
TCTAATTTTACACCTCCTACAATAGTCAATAGAAATAATTGGACAAATAATTTATCCAAT
GGGCCAGGTAGTGCACTCACTGCATCTTCTACTGCAAAAAAGCAAGCTGACATAAAGGAT
GTTGATTATTCAACCTTAGATTATTTGAATTAACCAGAAAGACCATTTGTTCCTCTTGAA
TCTAAAAATAAAGGAAAACATGTCTCTAAAAGTAACTAATACTACACAGTTGCAGATATT
AATGAATATGCAATAAAACCACATCCTTGGGATCAGAAGGTTAATGATATATTAGCTAAC
GTCTATGGCTATAAAAATTTTAGAAATAATTAAAGAGCAATTATAAATTGTGTCTTGGAG
AATAAAGATGTGTTTGCAATGATGCCCACTGGAGGTGGCAAATCTCTTACATTTTAAATA
CCTGGACTTGTCTAAGATGGAGTTTATATTGTTATTATGCCTCTTATTTCACTTATTTCT
GATTAATACAATCACATGCTTAGGCTCAATATTCCAGTTATCAGAGTTTAAGGAGCTAGG
AAGAACTACTAAAGAGAATTAGATTCAATACTTTATTCAGATAAGAATTAGTCTAAAATT
GTGTTAATCACACCAGAAAAAATATCATCAGATGAAGATTTTAACCAATTTTTAAGCTAA
ATTTATGAAAAAAATAAATTGAGAAGATTTGTTATTGATGAAGCTCACTGTGTTTCTTAA
TGGGGACACGAGTTTAGAAAAGATTATCTTTCTTTAGGATAGTTAAAAATAAAATATCCA
AACATTCCTACACTTGCTCTAACTGCTACAGCTACTGAAAAGTGCAAAATAGATATTATT
TAACTTCTTAATATGAAAGGAACTCTGTATTTTTAATCTTCTTTTAATCGTACAAATCTT
TACTACGATGTAGTAAGGATACCCTAAAAAGTAACAATCGAGCATATGGTTAATTTTATC
AAAGAAAAGTTTAATAAGCAAAGTGGTATTATATATTGCTGCACAAAAAAAGACTCAGAA
GAATTAGCTAGTAAGCTAAATATATAATATAAAATTAATGCAGCATATTATCACGGATCT
ATGAATGACAAAGAAAAAGAATAAGTTCAATAACTTTGGATGTCAAATGATATTTAAGTA
ATATGTGCCACAATAGCTTTTGGTATGGGTATCGACAAGCATGATGTCAGATTTGTCATC
CATTATACTTTTTCTAAATCTATCGAAAATTACTATTAAGAAGCAGGTAGAGCAGGAAGA
GATGGTAAAATATCTCACTGCAGAATTTACTACTCTCCAAAAGATAAAAATTCTTTAGTC
TTTTTGATCACTAATAATGAAGGCAGCAATAAATAGAAAAAAGAAGAATGCATGGCTCAT
TTAAGTAAAATGATAAGATATTGCGAAGATACAATTAATTGTAGAAGGGTTTTGCAATTA
GCACACTTGGGTGAAAAATTTGAACCTAAATTTTGCAATAAAATGTGCGATAACTGCAGA
AATTAAACTTCTAAAAGCAATATAATACAAAAAGATTTTACTTAAGATTGCAAAAATATA
CTATAAGAATATTTGAGTATGTATAATAAAAACATACAGCTGACTTAAAAGCAATTAGTA
GACGTTCTCAGAGGTAAAAAACTACAAAAAAAGGCAGGTTAAAACCTACTTAAAATGATT
GAAAACAGCTCAATCTATAGTCTATTAAAGAATTATGATTAATTAACTGTTGAAAATATT
GTTAAAGAAATGATGTCTTAGGGTTATTTGAGTGAAAAAATTAAAAAGTTTCGTGCTTAT
ACTTAAGTATTTCTTGAAGTAGTTAAGTCTAAGTATAATGAGTTATGTAATCCAAACAAA
ATGACTGACAAAATCATGATCAATTAAGTAGTTTCTCAAAGCTCTAAATCAAAAGTAGAT
AGTCAATTTTTATTTGACAAAGAATTAATTGATGATATTACAGAATCAGATTTACCTAAA
GAGTAAGAATTTTTTGATTAAAATAAAAATCTCATTTTTGATGATGAAGAATCACTATCT
TAAATGTCTGAAGGTGATTTAATAGATTTAATTGATCTTGCAAATAAGAATAAAACTTCT
TGCAACCAAAATGATTCGTCAGATAACATGTAAGAACTAAATAAATAGTATAGCGAAGAT
GATTCAGACTTTTAATTTTAAATACCTTCTGAGAGAAACTAATAAAGTAGAAGTGGGATT
ATTTATGAAGAAAATGATGAATAAAATTAAATTGGTCAAGCATATAGTGAGGATTATAAC
AGTCAAAATAAATAAGCTAATGAAAAACTAAACTAAGAACAGATATAAATTGAAGAGGAT
GATGATGACGATGATGACGACGATGATGATATTTTACAAATAGCAGCTAAAACAAATCTT
TTAGAATAAATAAAAAAATAAAACACGATGAGTGTAGAAAAATAAAATAGTTTGAAAGAA
AATTATCTTTATAAATCTCCTCAAGAATAAGATAATTTCTTTTCTGAATTTAAATTAGGC
AATAATAACAATAAACCTTAAACTTCTTTAGGATAAACAGGTCATAAGCCACCTTAATAA
AACAATTAAAATATGAGCTCATTGAATAATTTTAAATTTTCTACAGGAAACAATAAATTA
AAATAAGACTAAGCTGATCTTTTTTCATTTAACTTTCAAAAACTTGCAAAAAATTGA


>TTHERM_01030000(gene)
ATGGATGAAATATTGTAGTAATTTATAGATAGCAAAAGATAAGCAAAGAAGATAGAAGAT
TTTGCAGACGCTGTATCATGCAGTGCCACAGAAAGCTTAGAAGATTAGGACTAATCTTTT
GATAGAGGTGCTGATTTCAACGATGGAGAAGTAGATGATGCTTTATTGGATGAACTTATA
GAATATTAAACAAACAGAGAGCGTTAATCAATTACTGAAGAGTAAAATGATCTCATGAAA
ACTGAATTGTAAAAGCCAATAAGCAACAATTTAAATAAAAAATAACCAACTAGCTTGAGC
GGTTTGCAAAAAGGGTTAGGAAACAAAATATCTGGACCTTCTTATGATTTTAGTAACTCT
AATAATATGTAGACATTAAGCGGCATTTATAGTTCAAATTCTAACAATAACTCTTAGAAC
AGCAATGAGAACTTTAATGTAAAATATTTTATAAAAATCAAAATTAATTTAAATGCATAA
AAATAAAATAAAAAAGTTCAATAGACAAGGAAATACTACTCTAAAGCCTACGGGTTTTGA
TGCTATCAAGCTTAAAAAAAATTAGAATTAAGATTAATAGTAATAATAATAGCAATAGCA
AGTTCTGAAATTTGTAAATTAAAATAGTAATGGAGGGATTTAAGTAGAGGCTTCTTTAAC
AGATAAAAGAAGATAAGTAAATAACTCTAATGATATTGATAGTTTCATGTTGATCAATAA
CGGATAAAAAGAAAAAAAGACAAAAAATTAAAATTCTAAAATAAGTGAGTTGCTTGAGAA
GTACAAAGTGATAGATTCTAATTCAAATACTTAAAATTTCGAGTCTACTTCGCTTAATAC
TTCTCTCAATACCAAAAATAATAAATTAGAAGTTAAAAATGGGTTTTAAAATTTACCACA
AAAAACTGAAAAAATAGGGCTTGCAGCCTAAGCTGTAAATCAAAGCTCTAACGTACGTTC
TAATTTTACACCTCCTACAATAGTCAATAGAAATAATTGGACAAATAATTTATCCAATGG
GCCAGGTAGTGCACTCACTGCATCTTCTACTGCAAAAAAGCAAGCTGACATAAAGGATGT
TGATTATTCAACCTTAGATTATTTGAATTAACCAGAAAGACCATTTGTTCCTCTTGAATC
TAAAAATAAAGGAAAACATGTCTCTAAAAGTAACTAATACTACACAGTTGCAGATATTAA
TGAATATGTAAAATAATTTATTACAATTTCAGAAAAAAATTAACATTATTCTAATTAATT
CGATGAAGAAATAATTAAATTTATTTATTTTAATATTTTAATATTTTCTTTTTCCTCATC
AAAGAAAATTAAAAATATTTATTGATTAAAATGATTTATTTAATTTTCAAATATAAAAGG
CAATAAAACCACATCCTTGGGATCAGAAGGTTAATGATATATTAGCTAACGTCTATGGCT
ATAAAAATTTTAGAAATAATTAAAGAGCAATTATAAATTGTGTCTTGGAGAATAAAGATG
TGTTTGCAATGATGCCCACTGGAGGTGGCAAATCTCTTACATTTTAAATACCTGGACTTG
TCTAAGATGGAGTTTATATTGTTATTATGCCTCTTATTTCACTTATTTCTGATTAATACA
ATCACATGCTTAGGCTCAATATTCCAGTTATCAGAGTTTAAGGAGCTAGGAAGAACTACT
AAAGAGAATTAGATTCAATACTTTATTCAGATAAGAATTAGTCTAAAATTGTGTTAATCA
CACCAGAAAAAATATCATCAGATGAAGATTTTAACCAATTTTTAAGCTAAATTTATGAAA
AAAATAAATTGAGAAGATTTGTTATTGATGAAGCTCACTGTGTTTCTTAATGGGGACACG
AGTTTAGAAAAGATTATCTTTCTTTAGGATAGTTAAAAATAAAATATCCAAACATTCCTA
CACTTGCTCTAACTGCTACAGCTACTGAAAAGTGCAAAATAGATATTATTTAACTTCTTA
ATATGAAAGGAACTCTGTATTTTTAATCTTCTTTTAATCGTACAAATCTTTACTACGATG
TAGTAAGGATACCCTAAAAAGTAACAATCGAGCATATGGTTAATTTTATCAAAGGTAAAT
AAATCATAATTATTATTTTTCTTTATTTTAGCTAAAAAATTTTACTATTTTACAGAAAAG
TTTAATAAGCAAAGTGGTATTATATATTGCTGCACAAAAAAAGACTCAGAAGAATTAGCT
AGTAAGCTAAATATATAATATAAAATTAATGCAGCATATTATCACGGATCTATGAATGAC
AAAGAAAAAGAATAAGTTCAATAACTTTGGATGTCAAATGATATTTAAGTAATATGTGCC
ACAATAGGTAATAAAATTAGAAATAATTTAATTTGATTATTAAAAATTTTCAAATATATA
TAGCTTTTGGTATGGGTATCGACAAGCATGATGTCAGATTTGTCATCCATTATACTTTTT
CTAAATCTATCGAAAATTACTATTAAGAAGCAGGTAGAGCAGGAAGAGATGGTAAAATAT
CTCACTGCAGAATTTACTACTCTCCAAAAGATAAAAATTCTTTAGTCTTTTTGATCACTA
ATAATGAAGGCAGCAATAAATAGAAAAAAGAAGAATGCATGGCTCATTTAAGTAAAATGA
TAAGGTAAAATCTCTTTTATAACCAAAACCAATATTTATTAAATATTTAAGAATTAATTT
TACATATATATTTATTTTTTAAATTAAAAGTTTAAAATTAAATTTAGTAATTATTAAGTT
TTACAATATATATTGAATATTTATATATAGATATTGCGAAGATACAATTAATTGTAGAAG
GGTTTTGCAATTAGCACACTTGGGTGAAAAATTTGAACCTAAATTTTGCAATAAAATGTG
CGATAACTGCAGAAATTAAACTTCTAAAAGCAATATAATACAAAAAGATTTTACTTAAGA
TTGCAAAAATATACTATAAGAATATTTGAGTATGTATAATAAAAACATACAGCTGACTTA
AAAGCAATTAGTAGACGTTCTCAGAGGTAAAAAACTACAAAAAAAGGCAGGTTAAAACCT
ACTTAAAATGATTGAAAACAGCTCAATCTATAGTCTATTAAAGAATTATGATTAATTAAC
TGTTGAAAATATTGTTAAAGAAATGATGTCTTAGGGTTATTTGAGTGAAAAAATTAAAAA
GTTTCGTGCTTATACTTAAGTATTTCTTGAAGTAGTTAAGTCTAAGTATAATGAGTTATG
TAATCCAAACAAAATGACTGACAAAATCATGATCAATTAAGTAGTTTCTCAAAGCTCTAA
ATCAAAAGTAGATAGTCAATTTTTATTTGACAAAGAATTAATTGATGATATTACAGAATC
AGATTTACCTAAAGAGTAAGAATTTTTTGATTAAAATAAAAATCTCATTTTTGATGATGA
AGAATCACTATCTTAAATGTCTGAAGGTGATTTAATAGATTTAATTGATCTTGCAAATAA
GAATAAAACTTCTTGCAACCAAAATGATTCGTCAGATAACATGTAAGAACTAAATAAATA
GTATAGCGAAGATGATTCAGACTTTTAATTTTAAATACCTTCTGAGAGAAACTAATAAAG
TAGAAGTGGGATTATTTATGAAGAAAATGATGAATAAAATTAAATTGGTCAAGCATATAG
TGAGGATTATAACAGTCAAAATAAATAAGCTAATGAAAAACTAAACTAAGAACAGATATA
AATTGAAGAGGATGATGATGACGATGATGACGACGATGATGATATTTTACAAATAGCAGC
TAAAACAAATCTTTTAGAATAAATAAAAAAATAAAACACGATGAGTGTAGAAAAATAAAA
TAGTTTGAAAGAAAATTATCTTTATAAATCTCCTCAAGAATAAGATAATTTCTTTTCTGA
ATTTAAATTAGGCAATAATAACAATAAACCTTAAACTTCTTTAGGATAAACAGGTCATAA
GCCACCTTAATAAAACAATTAAAATATGAGCTCATTGAATAATTTTAAATTTTCTACAGG
AAACAATAAATTAAAATAAGACTAAGCTGATCTTTTTTCATTTAACTTTCAAAAACTTGC
AAAAAATTGA


>TTHERM_01030000(protein)
MDEILQQFIDSKRQAKKIEDFADAVSCSATESLEDQDQSFDRGADFNDGEVDDALLDELI
EYQTNRERQSITEEQNDLMKTELQKPISNNLNKKQPTSLSGLQKGLGNKISGPSYDFSNS
NNMQTLSGIYSSNSNNNSQNSNENFNFNRQGNTTLKPTGFDAIKLKKNQNQDQQQQQQQQ
QVLKFVNQNSNGGIQVEASLTDKRRQVNNSNDIDSFMLINNGQKEKKTKNQNSKISELLE
KYKVIDSNSNTQNFESTSLNTSLNTKNNKLEVKNGFQNLPQKTEKIGLAAQAVNQSSNVR
SNFTPPTIVNRNNWTNNLSNGPGSALTASSTAKKQADIKDVDYSTLDYLNQPERPFVPLE
SKNKGKHVSKSNQYYTVADINEYAIKPHPWDQKVNDILANVYGYKNFRNNQRAIINCVLE
NKDVFAMMPTGGGKSLTFQIPGLVQDGVYIVIMPLISLISDQYNHMLRLNIPVIRVQGAR
KNYQRELDSILYSDKNQSKIVLITPEKISSDEDFNQFLSQIYEKNKLRRFVIDEAHCVSQ
WGHEFRKDYLSLGQLKIKYPNIPTLALTATATEKCKIDIIQLLNMKGTLYFQSSFNRTNL
YYDVVRIPQKVTIEHMVNFIKEKFNKQSGIIYCCTKKDSEELASKLNIQYKINAAYYHGS
MNDKEKEQVQQLWMSNDIQVICATIAFGMGIDKHDVRFVIHYTFSKSIENYYQEAGRAGR
DGKISHCRIYYSPKDKNSLVFLITNNEGSNKQKKEECMAHLSKMIRYCEDTINCRRVLQL
AHLGEKFEPKFCNKMCDNCRNQTSKSNIIQKDFTQDCKNILQEYLSMYNKNIQLTQKQLV
DVLRGKKLQKKAGQNLLKMIENSSIYSLLKNYDQLTVENIVKEMMSQGYLSEKIKKFRAY
TQVFLEVVKSKYNELCNPNKMTDKIMINQVVSQSSKSKVDSQFLFDKELIDDITESDLPK
EQEFFDQNKNLIFDDEESLSQMSEGDLIDLIDLANKNKTSCNQNDSSDNMQELNKQYSED
DSDFQFQIPSERNQQSRSGIIYEENDEQNQIGQAYSEDYNSQNKQANEKLNQEQIQIEED
DDDDDDDDDDILQIAAKTNLLEQIKKQNTMSVEKQNSLKENYLYKSPQEQDNFFSEFKLG
NNNNKPQTSLGQTGHKPPQQNNQNMSSLNNFKFSTGNNKLKQDQADLFSFNFQKLAKN