Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01075780

Standard Name

RPA2 (RNA polymerase I subunit 2)

Aliases

PreTt02690 | 219.m00043

Description

RPA2 DNA-directed RNA polymerase; DNA-directed RNA polymerase I complex subunit

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677
• DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (IEA) | GO:0003899

Biological Process

• transcription (IEA) | GO:0006350

Domains

• ( PF00562 ) RNA polymerase Rpb2, domain 6
• ( PF02363 ) Cysteine rich repeat
• ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
• ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
• ( PF04563 ) RNA polymerase beta subunit
• ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
• ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
• ( PF06883 ) RNA polymerase I, Rpa2 specific domain
• ( PF09268 ) Clathrin, heavy-chain linker
• ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Stentor Coeruleus	SteCoe_17515	0
	Description: None
WormBase	WBGene00008781	9.997093137033517e-262
	Description: locus:rpoa-2 DNA-directed RNA polymerase status:Partially_confirmed UniProt:Q27493 protein_id:CAA99827.1
Tetrahymena borealis	EI9_15329.1	9.997093137033517e-262
	Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1160 aa)
DictyBase	DDB_G0293560	9.997093137033517e-262
	Description: rpa2 on chromosome: 6 position 3044865 to 3048492
Oxytricha	Contig2863.0.g30	9.997093137033517e-262
	Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD	YPR010C	9.997093137033517e-262
	Description: RPA135 RNA polymerase I second largest subunit A135
Tetrahymena borealis	EI9_12450.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (938 aa)
Tetrahymena borealis	EI9_03207.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (1710 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01075780(coding)
ATGAAGGAATCATTAAGTAGAGAAGATCATATTGCTCGTGCAAAGCAATCAAATTTAGAT
TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
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TGCATTGAAGAAGATATTAGAAACGATACTGAATACTAAGAACTCTCACCTTCATACATT
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ATGAGTGGTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAA
CCTAAATGCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTA
AGATACTTGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA

>TTHERM_01075780(gene)
ATGAAGGAATCATTAAGTAGAGAAGATCATATTGCTCGTGCAAAGCAATCAAATTTAGAT
TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
GATGAAGGATTAAAAAAAATCACTTAGTACTTGTAGCCAGTTGAAATTATTAAAGAATAA
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TCAAATATGATAAAATTTACTTTCGATTTTGACTTTTTTTTAAAGGAATTATAAAATAAC
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ATCATTGCCATTTAGCAAAAATGACTCCTAAGGAATTAGTGAAAGCTCACGAAGATTGCA
ATGAATTTGGTGGATATTTTATTGTCAATGGTAATGAAAAGATAGTCAGAATGCTTATCC
TTCAAAAAAGAAATTATCCTATTGCTTTTATCAGAGCAGGTTATGTTAATAGAGGTCCTA
ATTACACACCTTTTGCAGTTTAAATGAAGTGTGTGAGAGAAGATTTATACTCAAAAACAA
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TTTTTAAGGATGGTTCTAGACCCGAAGAAGCTATTAGAATTCCTCATATCGCTTACTTAA
AAAAAGCCATTGAATTTTAAGGCTCTATTGGAAATAAAATTGAATATTTCCTCTCTACTG
GTAATTTAAAATCCCAAACTGGTTTAGATCTCATGCAAGTAATATTTAAATTCATTTCTA
AAAAAATTTATATTGATTAAAAACTATCATAATAAAGGCTAAAGGTTTCACAATTATAGC
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TTTTACAGAAATGAAAACAACAACAGTTAGAAAATTATTACCTGAAAATTGGGGTTTCAT
TTGCCCTGTGCACACTCCTGATGGTGGTCCTTGCGGTTTGTTAAATCACATTTCTTAATC
ATGCAAACCCCTTACCAGACCTGGGTATGATGGTAATATTCACTTCAATTTAGTAACTCT
CTGCACTGAGATAGGTATGAATCCTATTGTAAACGATTTGTCTATCGTATTCCCTCCTAC
TTCTGTTACTATTATGCTTGATGGTAGAGTTATTGGTTATATTGAATCTAAAAATGCATA
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TGCTGATTTGGAAATCGGTTATGTTCCTAAACTTAATCTTGAAAAACAAAATATTTTCCC
AGGTATCTTTTTACACACTAATGAAGCTCGTTTTGTTCGTCCTGTTAAGCACTTGAAATT
AAATGCCTTAGAATGGATTACTCCTTTCGAATAAGTCCATCTTTCTATTGCTTGCATTGA
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TCTAAATATATGATACTTAAAAAAATGCTATGAAAACTTTCTACCACAAGGACTCAGAAT
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AATATAGAATTAGAATTCCCAGAAATCCTATTATTGGTGATAAATTCTCATCTCGTCACG
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GTATTACTCCTGATGTTATCATTAACCCTCACGCTTTCCCCTCCAGAATGACAATTGGTA
AATTTACTCTTTATTCAAGAAGATTAACTAATTAATTAAATTTTAATAAAAAAGGTATGT
TAATCGAAAGTATGGCAGGTAAATCTGGAGCTCTTAATGGAAATATATTAGAAACTTAAC
CTTTCTAAAATTATTAAGATGATGATATTGTTAATTATTTCGGTAAATAACTTTAATCTC
ATGGTTATAATTATTACGGTAACGAAGTTATGTATAGCGGTACATATGGTTGCATGATGA
AAGTTGATATCTATATGGGTATTGTATACTATCAAAGATTACGTCACATGGTATTTAAAA
TTTTTGTTAAAGATTGTTAATTAATTGTTATTTCTAATAATATATTAAAGGTTTCAGATA
AAGCTTAAGCAAGATCTACTGGTCCCGTTGATATGCTTACTTAACAACCTATTAAAGGTA
ATTATTAAAAAAATATGTCTTCTAGCTTACTTAATTATATACAAAAAAAAAAAAAAATAG
GTAGAAAGAGAGGTGGTGGTATTAGAATGGGTGAAATGGAAAGAGATGCTCTTCTTTCTC
ACGGTATCTCCTTCTGTATGCATGATAGATTCTTAAACTGCTCAGATTATTCTGAAGGTT
ATGTTTGTAATAGTTGTGGTTCATTGGTCTCAACATACCTACATACTAATTTAATGAGTG
GTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAACCTAAAT
GCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTAAGATACT
TGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA

>TTHERM_01075780(protein)
MKESLSREDHIARAKQSNLDFSKKLKQAAFAHIDSFNFIYDEGLKKITQYLQPVEIIKEQ
RSEEYKQSYLPFKSMKVWIENLEIATPIRADSGVAEDNKLMPEECRIGRKTYGAPLFAKV
ARSIDGGKPESINIRLGDIPIIVRSDHCHLAKMTPKELVKAHEDCNEFGGYFIVNGNEKI
VRMLILQKRNYPIAFIRAGYVNRGPNYTPFAVQMKCVREDLYSKTITLHYVSDGSVFLRI
LHRKQEFLIPAIVILKALADISDLQIYNKLVKGQSSKSAISDRVEVLIRGSKAMSLNTKE
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VTLCTEIGMNPIVNDLSIVFPPTSVTIMLDGRVIGYIESKNAQTFCQSLKYLKIMQDPTR
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RHGQKGVLSVLWPHIDMPFTESGITPDVIINPHAFPSRMTIGMLIESMAGKSGALNGNIL
ETQPFQNYQDDDIVNYFGKQLQSHGYNYYGNEVMYSGTYGCMMKVDIYMGIVYYQRLRHM
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RYLTNELAAMNIKLAFKLE