Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01080500

Standard Name

HARP2 (HepA-Related Protein 2)

Aliases

PreTt02092 | 222.m00048 | 3798.m00205

Description

helicase carboxy-terminal domain protein; Helicase conserved C-terminal domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20245.1 9.997093137033517e-262
Description: helicase domain-containing protein (1135 aa)
Oxytricha Contig18000.0.g59 1.0000832086161474e-142
Description: SNF2 family N-terminal domain
DictyBase DDB_G0274965 9.997540506729281e-98
Description: DDB_G0274965 on chromosome: 2 position 4676573 to 4680775
WormBase WBGene00015806 6.998237764718294e-90
Description: Putative SMARCAL1-like protein status:Partially_confirmed UniProt:Q8MNV7 protein_id:CCD63221.1
Stentor Coeruleus SteCoe_15873 5.166420632837861e-55
Description: None
SGD YPL082C 9.99648502569394e-38
Description: MOT1 Essential abundant protein involved in regulation of transcription, removes Spt15p (TBP) from DNA via its C-terminal ATPase activity, forms a complex with TBP that binds TATA DNA with high affinity but with altered specificity

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences 

>TTHERM_01080500(coding)
ATGTATTTTTAATAATTCTAGAAAGGTGGCTATGGGAATTTCAATCGATAAAATAGTAGC
AATTATAACTATAATAATAACAATAATAATGTTGATAAAAAACAAATAACTATTCAGCTT
GTTTAAGATAATACAATACTTATCTCTGGTTCGTATACAAGCTTTACAGAATAGAGAAAA
GATATCATAAAAAAATTAGGAGGTTCTTGGGATAATGACAGAAAGGGATGGAGATGTTAA
TATTCATAATATAATCTTATAAAATAAAATATAGAAAAGACAGGTGTTGAAATTTAAGGA
ATACCAGATTTTGTAAATAGTGCAATAAAGTCAATAAATGAAAAATTGACATTCCAAACA
GATAAAAAATAATATGAAATACTATATAATCCAGAAGACATAAATAAAAAAATAGAAAAT
GAGCTACCACAAAAAACAGTTACCAATCTGTATAATTTTCAAAAGCAAGGTGTGTAATTT
GGGTTAAAAAATAACGGTAGAGTTCTCATAGCTGATGAAATGGGTGTTGGTAAAACAATT
CAGGCTATCTGTTTAGCAAGCTGTTATAAATCTGCATGGCCGCTACTTATTATATGTCCA
TCTTCTTTAAAATATAATTGGAAAGAAGAAATTGTAAAATGGGCGTATCCTCCTCTTAAA
GAAATGCAGGTTCAGATATTGTCAAAATAAGCAGAAGAAATATATATAATGACTAGGGTT
TTAATTGTCTCATATGATCTGGCTCCAAAAGTTGAAGAAAAAATAAAAAGATTTAAAACT
AATATTGTAATTGCAGATGAAGCTCATTACTTAAAGAACGCTTAAGCTAAAAGGACGAAT
AGTTTATTACCAATTCTTTAAAAAATAAAACATGTTATTCTTTTGACTGGTACTCCTGCA
TTTGCTAGACCAAAAGAAATGTTTACTCTTCTTTCTATTATTCGCCCTGATATATTTAAG
ACTTTCAAAAGTTTTGGAGATAGATATTGTGATCCCAAACCAGCTAGATTTGGAGGAGGA
ATAGATTACACTGGTTCCACTAATGAAAAAGAATTATTCTATATTTTAAAGAAAACGATT
ATGATTAGGAGATTGAAATAAGATGTGCTCTCGTAATTGCCTTCAAAGAGAAGAAAAAAA
GTTCATGTTAACGTTGACCCAAAAATTTTATCAGAAATATAAGCAATTCTTAATCAAACA
AACAAAAGCTCTTTAGAATAACTGTTTGAGTAAGCTCAAAAATAAAATGAGTCAAGCAAT
GAAGAATAAAATGGCTCTTCATCAATGTTTTCTGCTCTTTCACTTTGCTACTAATTAAGT
GGATAAGCCAAGTTACATGAATTAAAAAACTATATTAAAGATTTATTGGAAAATGATATA
AAAATTATTGTATTTGCTCATCATAATGAAATGTTAAACTAGCTTGAAAATTTTGTTTAG
AATGAATTATAACTAAAATTTATTAGGATTGATGGTAAAGTTGCTCCTAAAGAGAGGCAC
GAAAGGGTTCAATAATTTTAAACAGACCCATAAGTAAAAGTTGCTATTCTATCTTTGTTA
GCTGCAAGTACTGGTCTGACATTAACAGCTTCCTCTAACATTGTTTTTGCAGAAATGAAT
TGGACACCTGCAATTATGCAGTAAGCAGAAGACAGAGCCCACAGAATTGGTTAAGAAAAC
AGTGTGCTATGTCATTATATTCTTGGAGAAAAAACACTTGATGACTTGCTTTACAAAAAA
ATAGAATAAAAAATAGCAATTGTAAGTAATATTCTTGACGGTGAATCTAAGGCTCTTAAG
ATAGACGAAGTATAAAAAGCAGAAAATGAAAATTAAATTATGGGTGATGATAATAATTAA
TATATAGAAGAAGATATTGAAGATTCTGCAAATGGGACATAAATGACCTAATAAAGATAA
ATGACTCAAGCTTAATTTTTACAATAATTGATACAAGAAAAAGAAAATAGAAAAATTTAA
AGTTCTTAGATTTCTGAGTAAATTAGCAATGCTGAGTCAACTGTCAATTAAAATTAAGTT
GAATAAGTTTTAAAACCTCTTAATATTTAAGTGAATAATAACTAATAATCTGAATCAGAA
AATAGTGATGATGACGAGGAAGAAGAACTTTTTATTCTTAAAATGATCGCCGCTTAGTCA
GCAAAAAGTTTAAAAGAAAAATAAAATAATATAGAAAAAAACTCAGTTATTAGTGATAAT
AATTAAAATAATGAAAAATTTAATCAAATGAGTGAAAAAACCAGTATTCAAAAAGAATAA
AATGATAAATAAATTCCTATTTTAGCTGAGATAAATGAAAAAATCTAAATAGAAGATGAC
GAAGCTGTAATTAATGAATATTAGATTAAAATAAGTGAAGAATGTAAAATACAAAAAAAT
GTTATCCCTTAAAAAGAAAGTAAGATACAATGTAATGATAATAAATATAATATACTTATC
AGCAGCATTGAAGATTCAAATATAAATCATGAATAAATAGATGATTATATCTATGATGAT
AACTAAAATTTAAGTATTGAATAAATTACATTATCGGTTGATAAATTAAACTCTACTGAA
AAAAAAGCTTAATAAAATCTAAGCACAAACAGTATTAATAATAATATATAAAAATTATAA
AATAATAATCTTAATACTATGAAAAATAATTAAAATCCCTAAGACTTGGAAACTTTTAAT
GAATTTTTATTCTCTTCTAGTAGTAAAAAGTAAAGCAATATCTTTTAGAAAAAAAGCGAA
ACAAAAAATAATGTTGAAAAGGAATAACAAGCAAATAAAATTAATAAATAAACTCCAAAA
GATAATAAAATTATACCAAAAACTGATGAATAAATCAGTACAAATAAAGTTGATAGCATA
AATAAATATCAATCTGATGAATTTTTTTATGATGATGAAGATTATTTTAATAGTATAAAG
CAGGATATTAAAACTAATAGTATTGATCTTTATAATTCTTAGTCTAAATAAAAAAACCCA
TCAGTTAATTTGACATAGAAATAGAAATAGTTTTTAAGGGCTGAAAACTACCAAAAAGGT
ATTAAAAAAATTATTTTTGACAATGGAGATGTTGAATATGTTTCTAGCTCAGAAGACTTA
GAATAATTTTATTCTAATAAGCTTGAAAGTAATGTTCAAAAAATAATTTCAAACAAACAA
GAAGAACCTAAATGTGATTATGATAGTGATGATGAATTATTTAGCTATTTAGATTAAAAC
TTCAGCTCTAAACAAGAATCTAATAAAGAACTTTCATATAGTAAGAGCAATTCTGATATA
TAATAACCTACAACTAGAAATGTAAGAAAAAGAGAAGATTTTGAATAAGATTTTGTAGAT
AGAAATGGAATTTCTGAATAAGATTGCAATTAAGTTTTTAATTAATTTTAACCATAAAAA
TAATCATCAATTTCAAAAAAATCACTTTTGAAATTAGCAAAGTAGCATTTTTGA


>TTHERM_01080500(gene)
ATGTATTTTTAATGTAATTAATTAACTAGCAATTAAAATCATTTTATTAAAGCAATCTAC
CTAATAAAAATACATTTAAATAAAATTATAAAAAGAATTCTAGAAAGGTGGCTATGGGAA
TTTCAATCGATAAAATAGTAGCAATTATAACTATAATAATAACAATAATAATGTTGATGT
AAAACAAATATTATAGTATGAAAAATATTCTTATTTTTATTTAAAACAACTAGAAAAAAC
AAATAACTATTCAGCTTGTTTAAGATAATACAATACTTATCTCTGGTTCGTATACAAGCT
TTACAGAATAGAGAAAAGATATCATAAAAGTATTCAATAATTATTTTCAGCAATCCTAAC
ATCAAATTTTCATTTTAAATGCAGAAATTAGGAGGTTCTTGGGATAATGACAGAAAGGGA
TGGAGATGTTAATATTCATAATATAATCTTATAAAATAAAATGTAATTCTTGATATTTAC
TTCTAAAAATTATGAAAAATAAAATGACAAAATACAAATACAAACAATTTTAATATGCAA
TTTAACTAATATAAAAGATAGAAAAGACAGGTGTTGAAATTTAAGGAATACCAGATTTTG
TAAATAGTGCAATAAAGTCAATAAATGAAAAATTGACATTCCAAACAGATAAAAAATAAT
ATGAAATACTATATAATCCAGAAGACATAAATGTATAATTAAGCAAAAAAATTTTAATTA
GGCAATTAGCTATTGTAAAAATATATTTAAGAAAAAAATAGAAAATGAGCTACCACAAAA
AACAGTTACCAATCTGTATAATTTTCAAAAGCAAGGTGTGTAATTTGGGTTAAAAAATAA
CGGTAGAGTTCTCATAGCTGATGAAATGGTGAATAAAATTTTAATTAAAATAAAAAAATA
TTTAATACTATAAAAATAGGGTGTTGGTAAAACAATTCAGGCTATCTGTTTAGCAAGCTG
TTATAAATCTGCATGGCCGCTACTTATTATATGTCCATCTTCTTTAGTAAATAATATTTT
ATTTTACTTCAAAAATTTATTATTAAATTGATTTGAAACAAGTAAAATAGTTTTAGTTAT
TTAATATAAAAATAATTTCCTTTCATTTTATAAAGAAGATTTAAATTTGATAATTTCAAA
AATAAAAAAACACTTTTATTGAGTTTTTAAAAATTCTAATTTCTTTTTAAATACAAATAT
TTAGTAAAACAAATCAAATAATTTACTTTATTATGTTGAAATTTGATTAGTTTTAGTTTT
TAAGGATCTAATTAAAAAATTTATACAAGTTAAATAACTTAAAACGATAAATGGAATTAA
TTAAATAACAAGTTTACTTTGAATATTTATTTTTAAAAATTCAATAGTTATCTTTAAATT
TTAACTAAAAATCTTAGAAATAACAATAAATAAATAAGCTTTGATTTTATAACTGTTAAA
AGAATAAAATACAATCGAGAAATGATTAAGAAATGCATAAATATATAGAGTTAAATTTTT
ATTTCTTTAGCAATACACCTAAGCGAATAGCAACTTTATTAAAAATAATTTTTTACGGTT
TTTAAACTGAAAACTTTTAAATTAAAATTAGAAATATAATTGGAAAGAAGAAATTGTAAA
ATGGGCGTATCCTCCTCTTAAAGAAATGCAGGTTCAGATATTGTCAAAATAAGCAGAAGA
AATATATATAATGACTAGGGTTTTAATTGTCTCATATGATCTGGCTCCAAAAGTTGAAGA
AAAAATAAAAAGATTTAAAACTAATATTGTAATTGCAGATGAAGCTCATTACTTAAAGAA
CGCTTAAGCTAAAAGGACGAATAGTTTATTACCAATTCTTTAAAAAATAAAACATGTTAT
TCTTTTGACTGGTACTCCTGCATTTGCTAGACCAAAAGAAATGTTTACTCTTCTTTCTAT
TATTCGCCCTGATATATTTAAGACTTTCAAAAGTTTTGGAGATAGATATTGTGATCCCAA
ACCAGCTAGATTTGGAGGAGGAATAGATTACACTGGTTCCACTAATGAAAAAGAATTATT
CTATATTTTAAAGAAAACGATTATGATTAGGAGATTGAAATAAGATGTGCTCTCGTAATT
GCCTTCAAAGAGAAGAAAAAAAGTTCATGTTAACGTTGACCCAAAAATTTTATCAGAAAT
ATAAGCAATTCTTAATCAAACAAACAAAAGCTCTTTAGAATAACTGTTTGAGTAAGCTCA
AAAATAAAATGAGTCAAGCAATGAAGAATAAAATGGCTCTTCATCAATGTTTTCTGCTCT
TTCACTTTGCTACTAATTAAGTGGATAAGCCAAGTTACATGAATTAAAAAACTATATTAA
AGATTTATTGGAAAATGATATAAAAGTAAATAACTTCTTTAATTATTTTATCAGTTTTTA
TTCAGCACCAACTTTTAAATACTTATTTTTTTTATTAAAAAATTAAAAAGTTTATAAAAA
AATTTCGTTAAAGTTTTATAAAAACTAATCAGTATTCAAAATTTTTCTATAAACTTTAAC
TTATAATTTAGAATTTTTCCGTTTTTCTATTAAATAAATTATTGTTCTTATTTAAAAAAA
TAGATTATTGTATTTGCTCATCATAATGAAATGTTAAACTAGCTTGAAAATTTTGTTTAG
AATGAATTATAACTAAAATTTATTAGGATTGATGGTAAAGTTGCTCCTAAAGAGAGGCAC
GAAAGGGTTCAATAATTTTAAACAGACCCATAAGTAAAAGTTGCTATTCTATCTTTGTTA
GCTGCAAGTACTGGTCTGACATTAACAGCTTCCTCTAACATTGTTTTTGCAGAAGTAAAA
ACTTCATTATTAAAAAATAATATTCATTTAATAAAATTATTTTAGATGAATTGGACACCT
GCAATTATGCAGTAAGCAGAAGACAGAGCCCACAGAATTGGTTAAGAAAACAGTGTGCTA
TGTCATTATATTCTTGGAGAAAAAACACTTGATGACTTGCTTTACAAAAAAATAGAATAA
AAAATAGCAATTGTAAGTAATATTCTTGACGGTGAATCTAAGGCTCTTAAGATAGACGAA
GTATAAAAAGCAGAAAATGAAAATTAAATTATGGGTGATGATAATAATTAATATATAGAA
GAAGATATTGAAGATTCTGCAAATGGGACATAAATGACCTAATAAAGATAAATGACTCAA
GCTTAATTTTTACAATAATTGATACAAGAAAAAGAAAATAGAAAAATTTAAAGTTCTTAG
ATTTCTGAGTAAATTAGCAATGCTGAGTCAACTGTCAATTAAAATTAAGTTGAATAAGTT
TTAAAACCTCTTAATATTTAAGTGAATAATAACTAATAATCTGAATCAGAAAATAGTGAT
GATGACGAGGAAGAAGAACTTTTTATTCTTAAAATGATCGCCGCTTAGTCAGCAAAAAGT
TTAAAAGAAAAATAAAATAATATAGAAAAAAACTCAGTTATTAGTGATAATAATTAAAAT
AATGAAAAATTTAATCAAATGAGTGAAAAAACCAGTATTCAAAAAGAATAAAATGATAAA
TAAATTCCTATTTTAGCTGAGATAAATGAAAAAATCTAAATAGAAGATGACGAAGCTGTA
ATTAATGAATATTAGATTAAAATAAGTGAAGAATGTAAAATACAAAAAAATGTTATCCCT
TAAAAAGAAAGTAAGATACAATGTAATGATAATAAATATAATATACTTATCAGCAGCATT
GAAGATTCAAATATAAATCATGAATAAATAGATGATTATATCTATGATGATAACTAAAAT
TTAAGTATTGAATAAATTACATTATCGGTTGATAAATTAAACTCTACTGAAAAAAAAGCT
TAATAAAATCTAAGCACAAACAGTATTAATAATAATATATAAAAATTATAAAATAATAAT
CTTAATACTATGAAAAATAATTAAAATCCCTAAGACTTGGAAACTTTTAATGAATTTTTA
TTCTCTTCTAGTAGTAAAAAGTAAAGCAATATCTTTTAGAAAAAAAGCGAAACAAAAAAT
AATGTTGAAAAGGAATAACAAGCAAATAAAATTAATAAATAAACTCCAAAAGATAATAAA
ATTATACCAAAAACTGATGAATAAATCAGTACAAATAAAGTTGATAGCATAAATAAATAT
CAATCTGATGAATTTTTTTATGATGATGAAGATTATTTTAATAGTATAAAGCAGGATATT
AAAACTAATAGTATTGATCTTTATAATTCTTAGTCTAAATAAAAAAACCCATCAGTTAAT
TTGACATAGAAATAGAAATAGTTTTTAAGGGCTGAAAACTACCAAAAAGGTATTAAAAAA
ATTATTTTTGACAATGGAGATGTTGAATATGTTTCTAGCTCAGAAGACTTAGAATAATTT
TATTCTAATAAGCTTGAAAGTAATGTTCAAAAAATAATTTCAAACAAACAAGAAGAACCT
AAATGTGATTATGATAGTGATGATGAATTATTTAGCTATTTAGATTAAAACTTCAGCTCT
AAACAAGAATCTAATAAAGAACTTTCATATAGTAAGAGCAATTCTGATATATAATAACCT
ACAACTAGAAATGTAAGAAAAAGAGAAGATTTTGAATAAGATTTTGTAGATAGAAATGGA
ATTTCTGAATAAGATTGCAATTAAGTTTTTAATTAATTTTAACCATAAAAATAATCATCA
ATTTCAAAAAAATCACTTTTGAAATTAGCAAAGTAGCATTTTTGA


>TTHERM_01080500(protein)
MYFQQFQKGGYGNFNRQNSSNYNYNNNNNNVDKKQITIQLVQDNTILISGSYTSFTEQRK
DIIKKLGGSWDNDRKGWRCQYSQYNLIKQNIEKTGVEIQGIPDFVNSAIKSINEKLTFQT
DKKQYEILYNPEDINKKIENELPQKTVTNLYNFQKQGVQFGLKNNGRVLIADEMGVGKTI
QAICLASCYKSAWPLLIICPSSLKYNWKEEIVKWAYPPLKEMQVQILSKQAEEIYIMTRV
LIVSYDLAPKVEEKIKRFKTNIVIADEAHYLKNAQAKRTNSLLPILQKIKHVILLTGTPA
FARPKEMFTLLSIIRPDIFKTFKSFGDRYCDPKPARFGGGIDYTGSTNEKELFYILKKTI
MIRRLKQDVLSQLPSKRRKKVHVNVDPKILSEIQAILNQTNKSSLEQLFEQAQKQNESSN
EEQNGSSSMFSALSLCYQLSGQAKLHELKNYIKDLLENDIKIIVFAHHNEMLNQLENFVQ
NELQLKFIRIDGKVAPKERHERVQQFQTDPQVKVAILSLLAASTGLTLTASSNIVFAEMN
WTPAIMQQAEDRAHRIGQENSVLCHYILGEKTLDDLLYKKIEQKIAIVSNILDGESKALK
IDEVQKAENENQIMGDDNNQYIEEDIEDSANGTQMTQQRQMTQAQFLQQLIQEKENRKIQ
SSQISEQISNAESTVNQNQVEQVLKPLNIQVNNNQQSESENSDDDEEEELFILKMIAAQS
AKSLKEKQNNIEKNSVISDNNQNNEKFNQMSEKTSIQKEQNDKQIPILAEINEKIQIEDD
EAVINEYQIKISEECKIQKNVIPQKESKIQCNDNKYNILISSIEDSNINHEQIDDYIYDD
NQNLSIEQITLSVDKLNSTEKKAQQNLSTNSINNNIQKLQNNNLNTMKNNQNPQDLETFN
EFLFSSSSKKQSNIFQKKSETKNNVEKEQQANKINKQTPKDNKIIPKTDEQISTNKVDSI
NKYQSDEFFYDDEDYFNSIKQDIKTNSIDLYNSQSKQKNPSVNLTQKQKQFLRAENYQKG
IKKIIFDNGDVEYVSSSEDLEQFYSNKLESNVQKIISNKQEEPKCDYDSDDELFSYLDQN
FSSKQESNKELSYSKSNSDIQQPTTRNVRKREDFEQDFVDRNGISEQDCNQVFNQFQPQK
QSSISKKSLLKLAKQHF