Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01080500

Standard Name

HARP2 (HepA-Related Protein 2)

Aliases

PreTt02092 | 222.m00048 | 3798.m00205

Description

helicase carboxy-terminal domain protein; Helicase conserved C-terminal domain containing protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

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Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20245.1 9.997093137033517e-262
Description: helicase domain-containing protein (1135 aa)
Oxytricha Contig18000.0.g59 1.0000832086161474e-142
Description: SNF2 family N-terminal domain
DictyBase DDB_G0274965 9.997540506729281e-98
Description: DDB_G0274965 on chromosome: 2 position 4676573 to 4680775
WormBase WBGene00015806 6.998237764718294e-90
Description: Putative SMARCAL1-like protein status:Partially_confirmed UniProt:Q8MNV7 protein_id:CCD63221.1
Stentor Coeruleus SteCoe_15873 5.166420632837861e-55
Description: None
SGD YPL082C 9.99648502569394e-38
Description: MOT1 Essential abundant protein involved in regulation of transcription, removes Spt15p (TBP) from DNA via its C-terminal ATPase activity, forms a complex with TBP that binds TATA DNA with high affinity but with altered specificity

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences 

>TTHERM_01080500(coding)
ATGTATTTTTAATAATTCTAGAAAGGTGGCTATGGGAATTTCAATCGATAAAATAGTAGC
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>TTHERM_01080500(gene)
ATGTATTTTTAATGTAATTAATTAACTAGCAATTAAAATCATTTTATTAAAGCAATCTAC
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TCTTTTGACTGGTACTCCTGCATTTGCTAGACCAAAAGAAATGTTTACTCTTCTTTCTAT
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TAATAAAATCTAAGCACAAACAGTATTAATAATAATATATAAAAATTATAAAATAATAAT
CTTAATACTATGAAAAATAATTAAAATCCCTAAGACTTGGAAACTTTTAATGAATTTTTA
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AATGTTGAAAAGGAATAACAAGCAAATAAAATTAATAAATAAACTCCAAAAGATAATAAA
ATTATACCAAAAACTGATGAATAAATCAGTACAAATAAAGTTGATAGCATAAATAAATAT
CAATCTGATGAATTTTTTTATGATGATGAAGATTATTTTAATAGTATAAAGCAGGATATT
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ATTATTTTTGACAATGGAGATGTTGAATATGTTTCTAGCTCAGAAGACTTAGAATAATTT
TATTCTAATAAGCTTGAAAGTAATGTTCAAAAAATAATTTCAAACAAACAAGAAGAACCT
AAATGTGATTATGATAGTGATGATGAATTATTTAGCTATTTAGATTAAAACTTCAGCTCT
AAACAAGAATCTAATAAAGAACTTTCATATAGTAAGAGCAATTCTGATATATAATAACCT
ACAACTAGAAATGTAAGAAAAAGAGAAGATTTTGAATAAGATTTTGTAGATAGAAATGGA
ATTTCTGAATAAGATTGCAATTAAGTTTTTAATTAATTTTAACCATAAAAATAATCATCA
ATTTCAAAAAAATCACTTTTGAAATTAGCAAAGTAGCATTTTTGA


>TTHERM_01080500(protein)
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