Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01093530

Standard Name

MAF4 (membrane flagellar associated protein 4)

Aliases

PreTt16926 | 230.m00035 | 3806.m00216

Description

MAF4 WD40 repeat protein

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_21300 0
Description: None
WormBase WBGene00001118 9.997093137033517e-262
Description: locus:dyf-2 status:Confirmed UniProt:G5ECZ4 protein_id:CAL49447.1
Tetrahymena borealis EI9_20568.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1388 aa)
Oxytricha Contig889.1.g68 9.997093137033517e-262
Description: Region in Clathrin and VPS
Tetrahymena borealis EI9_15337.1 9.997093137033517e-262
Description: biotin/lipoate A/B protein ligase (388 aa)
Tetrahymena borealis EI9_20218.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1424 aa)

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
29 MAF4 Tetrahymena thermophila MAF4 is homologous with proteins from the WD40 superfamily, mostly membrane and flagellar associated proteins. It contains two domains; the first domain (E-value=1.95E-5), in the clathrin family, indicates that the protein could have a membrane spanning domain due to repeated alpha-helices. The second domain (E-value=7.46E-3) is a kinase complex, which indicates possible movement function, and correlates with the homologs being flagellar associated proteins. It is possible that this protein is an integral membrane protein that has a function in flagellar movement. Paragraph by: Lauren Mitten and Rebecca Dutta (undergraduates), Keck Science Department, Scripps College

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_01093530(coding)
ATGGCATCAAGCAAGAAAGTTTTTGAATTCAAAGATGACCTCAATGGTAGCGGAAAAGTG
TTATTTTCATGGAGCTAAGATTGTAGTTATATCGCAGTTTGTGGATAATCGAAGGTGGTT
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GAAAAATACAAAACTAGAATTGAAAACATTGCTAGAAAGCCACTAAAAGAAGAGCCTGTG
GAAAACAAAACTGAGTGTCCATTCTGCAAAGAATATGTAGGCGAATTTTAGTTAGTCTGT
GAATCTTGTTAAAACGTCATACCCTTTTGTATTGCTTCAGGAACACACGTTATTGCTGAC
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GCTGAATCAGAAGAGGGAAGATGCCCTATGTGTTCAGTTTAAATTAATTTAAATGAAGTA
AAAGTGGAAAATCCAGAACAGGCTGCTTCTATATTAAAATAACTTAGAGCAACAAGATAA
AGTTCTGAGTAAAAGAAAAAATGA


>TTHERM_01093530(gene)
ATGGCATCAAGCAAGAAAGTAATACTTGTTAATCTATTTTTTAGCCAAATTTTAATTGGA
AGTGGAGTTAGATTATTGCGAGTTCTAAATCACTTAATCTTTACTTGATAATTATATCTT
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CTTAGAATTTTTAAAAAATATCTTATTAAATAAAATTCAAAGACATAAAAAATCCTGGAC
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TTAAGTGCTTCACACCAAGTGGTAGTATAAACGGCTAGAATTTAACTTCCCATAGTTACT
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TTATATATTGAATCAAAAGACTTTAAAAAAGCTGCTCCTTTAATCAGCATGATAAAATCC
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GTTTGCAAAAATATAAGTTAATTCCCCACTCACGCTGTCAATATTTTAACATCTGCAGTA
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TTAGTTAGTCTGTGAATCTTGTTAAAACGTCATACCCTTTTGTATTGCTTCAGGAACGTA
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>TTHERM_01093530(protein)
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VIGLEWDKDQEFLAILQENSTCFLLWNVFQNSFEQQDLEEKSKGSFIKWSKTHPVLVIGT
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TVQHEPSNLQWARQKTDDRDSSQRTITAILSNKSILMYDLNTKKQPLELVYEPKYGKIVD
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VCFDNKGSAYLFEPAQEQFYPLEHFPQRAEKVLWDQKDPNLFAVLQNDTLITFIINKNNI
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