Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01093550

Standard Name

SPT6 (SuPressor of Tys 6)

Aliases

PreTt16928 | 230.m00037 | 3806.m00218

Description

SPT6 zinc knuckle protein; Zinc knuckle family protein; homolog of SPT6 in S. cerevisiae; contains SH2 phosphorylated tyrosine binding pocket; transcription elongation factor; H3-H4 chaperone

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01742 ) Micronucleus: PAR1 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette. Macronucleus: SPT6 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20570.1 9.997093137033517e-262
Description: zinc knuckle family protein (1499 aa)
Oxytricha Contig16618.0.1.g58 2.999467474389571e-105
Description: Zinc knuckle
DictyBase DDB_G0272354 1.0001478224244938e-84
Description: spt6 on chromosome: 2 position 1271354 to 1276784
SGD YGR116W 1.0004249259458435e-52
Description: SPT6 Transcription elongation factor required for the maintenance of chromatin structure during transcription in order to inhibit transcription from promoters within the coding region
Stentor Coeruleus SteCoe_11339 9.221146422925876e-47
Description: None
WormBase WBGene00001259 4.9986056260133516e-43
Description: locus:emb-5 Suppressor of Ty 6 homolog status:Confirmed UniProt:P34703 protein_id:CAA84737.1
WormBase WBGene00007363 4.9986056260133516e-43
Description: locus:stdh-1 Putative steroid dehydrogenase 1 status:Confirmed UniProt:Q17703 protein_id:CAB01114.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01093550(coding)
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GAAGAAGAAGATTATTAAGGGCAAGTAGAAGAAGAGGAAGATGGCAACAATCAAGTAGAA
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GACAACGAGCATTGA


>TTHERM_01093550(gene)
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GAAGAAGAAGATTATTAAGGGCAAGTAGAAGAAGAGGAAGATGGCAACAATCAAGTAGAA
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>TTHERM_01093550(protein)
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DNEH