Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01179960

Standard Name

EXO1 (EXOnuclease 1)

Aliases

PreTt04565 | 265.m00045

Description

EXO1 XPG I-region family protein; XPG I-region family protein; involved in DNA double-stranded break repair; homolog of budding yeast- fission yeast and mouse EXO1

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20915.1 9.997093137033517e-262
Description: XPG I-region family protein (881 aa)
Oxytricha Contig18799.0.g41 1.0001267035975107e-72
Description: XPG I-region
DictyBase DDB_G0291570 1.0004460510701209e-64
Description: exo1 on chromosome: 6 position 561048 to 564580
SGD YOR033C 6.001055639413166e-58
Description: EXO1 5-3 exonuclease and flap-endonuclease involved in recombination, double-strand break repair and DNA mismatch repair; member of the Rad2p nuclease family, with conserved N and I nuclease domains
WormBase WBGene00009731 1.0002335610448659e-38
Description: locus:exo-1 status:Confirmed UniProt:O62245 protein_id:CAB07612.2
Stentor Coeruleus SteCoe_33040 5.380186160021138e-32
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:26519827: Lukaszewicz A, Shodhan A, Loidl J (2015) Exo1 and Mre11 execute meiotic DSB end resection in the protist Tetrahymena. DNA repair 35( ):137-43

Sequences

>TTHERM_01179960(coding)
ATGGGTATTACTGGATTATTAAACCTGCTGAAAAGTATAGTAGTAAAAAGACATTTAAAA
GAATACAAAGACAAAACTGTGGCTATTGATGCTTATACATGGCTTCATCCTGCTATTTAT
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AATTTTTTAGAGAAGTTTTCAATGTTCTTTAAGAATGAAGTGAACATTTGA


>TTHERM_01179960(gene)
ATGGGTATTACTGGATTATTAAACCTGCTGAAAAGTATAGTAGTAAAAAGACATTTAAAA
GAATACAAAGACAAAACTGTGGCTATTGATGCTTATACATGGTATCATTCATTATTACTT
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CGCTTCTAATATGTATACTGTCCTATCAAAGAAGAGATTAGGACATTAAATACTTATAAT
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ACAAAGAAAATGATAGCCAAGAAGATAATAAATCATGCATTTCAACTCAATCATAAAAAA
ATTTGATAAGCTAAGACGTTGGAGGCATACAAAATAGTGAAAAATATTAATCATAAAAAT
GTACTCAAAAAACCATCTCAGAAGAATTATCTTGTTAAGGTAGTAATGATCAGCAAGGAG
AAAATACCATATTATCTAGAATGAATAATTTTACTAAAGAGACTGATGGCTAGTTAGTTA
TAGATTCATAATATTTAATTCAAAGACATCCTGAATATAATTTTTTAGAGAAGTTTTCAA
TGTTCTTTAAGAATGAAGTGAACATTTGA


>TTHERM_01179960(protein)
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