Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01205350

Standard Name

AXE2 (Ankyrin/histone H3 methyl transferase and EXosome 3-5 exoribonuclease 2)

Aliases

PreTt02725 | 273.m00030

Description

AXE2 3-prime-5-prime exonuclease; 3'-5' exonuclease family protein; identified by homology with AXE1

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

  • nucleobase-containing compound metabolic process (IEA) | GO:0006139

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20551.1 9.997093137033517e-262
Description: 3-5 exonuclease (1106 aa)
Oxytricha Contig6366.0.g39 1.0004249259458435e-52
Description: Ankyrin repeats (3 copies)
SGD YOR001W 6.996829646809514e-23
Description: RRP6 Nuclear exosome exonuclease component; has 3-5 exonuclease activity; involved in RNA processing, maturation, surveillance, degradation, tethering, and export; has similarity to E. coli RNase D and to human PM-Sc1 100 (EXOSC10); mutant displays reduced transcription elongation in the G-less-based run-on (GLRO) assay
DictyBase DDB_G0271572 2.0002795641672355e-21
Description: exosc10 on chromosome: 2 position 601251 to 605014
Stentor Coeruleus SteCoe_36399 1.0530617357553812e-20
Description: None
WormBase WBGene00000796 8.002082816694397e-20
Description: locus:crn-3 status:Confirmed UniProt:G5EBX6 protein_id:CAA90108.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_01205350(coding)
ATGGATTAAAGTATTAACTAGTAAAACTGGGAATCTCTTCTTGTTTAAGAGCTTTTCAAC
AATGAAATCCTTGATTTTATAGATAATGGATTGAATACAAAACCTTAATAGCTTCTTTAC
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TATGATTCTTTTATAACTTTGATATTATTTTTTGTTATGAAATCTACAATATCCTAAGAA
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TCGTTTGATTTTAATAAACTATTTTTAATTAAAGATAACTAAAATATATAATGA


>TTHERM_01205350(gene)
ATGGATTAAAGTATTAACTAGTAAAACTGGGAATCTCTTCTTGTTTAAGAGCTTTTCAAC
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GAGTAATTTTGTGTCAAAAATCTTAACTTTGATAAACAGCTCGTTGAATTTTAAATTCCT
GAGTATGATATCGTAGGAATCGAAGATTATTTAAAATCATTAAAAGATAAAGTTTCAGAA
AATGTTTACATGCAGGAAAAATAACACTATTGCTATCTAATAGAACCTGAAATGAAATTT
AATCTTAACAGACCTTTATTAGAATAAATTATTTAGGTAAATTAATGATATATAATGTTT
AATAAAATAACTATATTAAAAATAGGAGGTAGATGAATCAAAAAAAGTAGAAATTTATGA
GTTACACAATCAAAATGACTCTTAGTTCTATTAAGAAATAAATAGTATTTCTTTTGATAA
AAAACCATTACATATAAAAAATAAAATGAATTCTTTACCTTCCATATTTGTAGATAAAGA
AGAGTAACTTATAGAAAAAGTTATTCCAGATCTTTTATAGCATTAAATCATAGGTATAGA
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GTCTACTTTATCATCAAATTTTGTTATCGATATTCTTAATCTCAGTAAATCAGTATCTGT
ACATCTAAAGAGCATATTTGAATCTCCTAAATTTGTTAAAGTAAATTACTATTTTTATTT
TTAAAAAATGATAATAATATCTATTATTTAATAATTGCTGAATAAAGTTAATCCCTTATC
GAATTATTTATATTTTAAATAAATTATATTTTTTAATAGGTATTTCATGGTGGTGAAACA
GATTTAAAACTACTAAAAAAAGATTTAAACTTTAATTTAGTAAATATATTTGATACTGCA
AAAGCTTATCTTAAACAAAATAAAGGAGCTGGATCAGTTTCTTTAAGTTCTCTTAGTTAG
TAGTATTTAAATTATAATGTTGATAAATAGTACTAAACTTCTGATTGGAGGATAAGACCT
CTCCCAAAGCCGATGCTTAATTATGCAATGTATGATTCTTTTATAACTTTGATATTATTT
TTTGTTATGAAATCTACAATATCCTAAGAAGATTTAAGCATAATAGCAATAAGTTGTAAC
AAAATGTGTATTAAATAGCTAGAAAAATCTTCGTTTGATTTTAATAAACTATTTTTAATT
AAAGATAACTAAAATATATAATGA


>TTHERM_01205350(protein)
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SESNSGFKLLHVEDENDDQKLEYFLKNTITTYDQNIQTIVNCQELVKAKEEQYKYLVRLD
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NQFEKVQQMLVDGTNIEAIDTVEQFTAAHIACDVGNMEMIRLLDSYNCNWEALDHEQMTP
LYYAIRGENLPTVKFLVEEKKVNIEHKEFMHRTPFYWACCLGNLRIIRFLTEAGADINAK
TKLMRTALNKACFLGRADVGTFGKDCPEAALLLLEKGVNVDAEDVDQSTPLHIACSSEAL
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GSVSLSSLSQQYLNYNVDKQYQTSDWRIRPLPKPMLNYAMYDSFITLILFFVMKSTISQE
DLSIIAISCNKMCIKQLEKSSFDFNKLFLIKDNQNIQ