Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01216140

Standard Name

DCR1 (DiCeR 1 )

Aliases

PreTt28880 | 277.m00034 | 3823.m01226

Description

DCR1 type III restriction enzyme res subunit; Dicer-related RNase III protein; one of three Dicer-like proteins described in T. thermophila

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01928 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR1 with neo3 Macronucleus: Loss of part of DCR1 locus and of the neo3 used to KO.
  • ( SD01929 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR1 with neo3 Macronucleus: Loss of part of DCR1 locus and of the neo3 used to KO.
  • ( SD02158 ) Micronucleus: heterozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02177 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02178 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02179 ) Micronucleus: heterozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02833 ) Micronucleus: Nee3 cassette into DCR1 locus
  • ( SD02834 ) Micronucleus: Nee3 cassette into DCR1 locus

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_10671.1 2.9990837046884738e-127
Description: hypothetical protein (698 aa)
WormBase WBGene00017121 2.9990837046884738e-127
Description: locus:cyc-2.1 Cytochrome c 2.1 status:Confirmed UniProt:P19974 protein_id:CCD68708.1
WormBase WBGene00000939 0.0000000000006997872742366828
Description: locus:dcr-1 Endoribonuclease dcr-1 status:Partially_confirmed UniProt:P34529 protein_id:CCD71200.2
SGD YIR002C 0.00020003864201578029
Description: MPH1 Member of the DEAH family of helicases, functions in an error-free DNA damage bypass pathway that involves homologous recombination, binds to flap DNA and stimulates activity of Rad27p and Dna2p; mutations confer a mutator phenotype

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16357212: Lee SR, Collins K (2006) Two classes of endogenous small RNAs in Tetrahymena thermophila. Genes & development 20(1):28-33
  2. Ref:16199890: Malone CD, Anderson AM, Motl JA, Rexer CH, Chalker DL (2005) Germ line transcripts are processed by a Dicer-like protein that is essential for developmentally programmed genome rearrangements of Tetrahymena thermophila. Molecular and cellular biology 25(20):9151-64
  3. Ref:15598983: Mochizuki K, Gorovsky MA (2005) A Dicer-like protein in Tetrahymena has distinct functions in genome rearrangement, chromosome segregation, and meiotic prophase. Genes & development 19(1):77-89

Sequences 

>TTHERM_01216140(coding)
ATGGATTTCAGTCAGTTTAAAGACGAAAGTAGCTCTGAATCCAATTTTGAAGAATAAGAT
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AGCAAATTTTATGCCTTAGTTGCTGTTTACAATAATAATAAGATAAAATTATAAAACCAT
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CCAATAGTTTTCGACTGTTTAATTAATGAAAGAGGTTAGTATTTGTCTCTTATCATTTTA
CCTTTTCAACTCTAAGCAAATATTTTTATGAATCTCCAGAAGCTAAAATTTAAAAAAGAA
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CATCCCTTTTATCTCTATGATATATAATACAAGGGTGAATTACTTTAAGTTAAACTTATT
TATGACAAGCAGTGTTTAGAAGGCTTTATCCATTAAGATATTAAATTTATCTTCCATAAC
TAAATTAATTTAAGCAATGAAGAATTAAACGAAATTAGAAAAATTAACCAATAAGCTCAT
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TTAACAGAAAGAGATTTAATCTAAATTTTTTAGAAAAAATAATTAGAGAAAAACCTTGTG
TTTTTAGGAAAGTAATATTTCAGATTTATAACCAGCATTAATGTTTTCAATGAAAACTTT
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CTTATTGATAAGGTTTTTGAATGCCAAAGAATCGAAGAGGCATATTTGGCTATCAAAGAA
TAAATCATTAACAACCCAATAAATTAATAGTCTTTATGA


>TTHERM_01216140(gene)
ATGGATTTCAGTCAGTTTAAAGACGAAAGTAGCTCTGAATCCAATTTTGAAGAATAAGAT
AGAGTAGAAAGCTTCTTGAAAAAGAATGAAACAATTTTAGATTATAGCAGCATTGATTAA
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TTTTGCTATATTTTAAATAAATAATTTTTTAGTTTAAATTGATCATATTTGACGAATGCC
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ATCATTATTTTAATTTATCAAATAGGTAATTAATTTTATATTCAAATGTTTTATTTTTTA
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TTGATATTTTGTAATAGCAAAGTTGTTGTCAAATATGTCACGAAGTTCATTTAAAGTGTA
TTCTAAAATAGTAATTCAGACTAAAAATGTTGCGAATATATAATGGGATAAAGTAAATAA
ATATTTATTTTCTTTGTATGTATATTTGATATATTACTTATTTTATCATAAACAGCAAGC
CAAAATAAAAAAGATGAAGAAGATGATAATAATTTAAAAATAATAAATAGCATAAATCCG
TATGAAATCTAAAACTTAAAATCGTAAAGTGTATAATAAGCTTAGAACATTATACAACAA
GAAAAATAATTTAGTATCAAATTTTATGCGCTAAAATAAAAATACTCTGAACAATAAAAG
ATTGTTGAGAGATTCAGAAACAAATAATTCAAAATTTTAGTAAGCACTAGTGTTGTTGAA
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AGATAATATATACAAATGAAAGGTAGAGCTAGAGCAGAAAATAGCAAATTTTATGCCTTA
GTTGCTGTTTACAATAATGTAATATTTACTTTTAATATTCATTCTTACTTACTTACTTAC
TTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTAATTAT
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CATTTTACCTTTTCAACTCTAAGCAAATATTTTTATGAATCTCCAGAAGCTAAAATTTAA
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AAGTATTTGTAGGATATTTAAATGGAAAAAAGAGATAAATTGTTGTCTACAAAAAACTTT
ATCGTTAAATTGTAGATGAAGTTTTTGTTTAAAAAGAATAAATCTAATAAAGAGAATTTC
ATCCCTTTTATCTCTATGATATATAATACAAGGGTGAATTACTTTAAGTTAAACTTATTT
ATGACAAGCAGTGTTTAGAAGGCTTTATCCATTAAGATATTAAATTTATCTTCCATAACT
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TTAAGCAATGAAGAATTAAACGAAATTAGAAAAATTAACCAATAAGCTCATTTAAAGTTA
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TCAAATGATGTACTTTCATTTTTAGGATCTATAATATTCTCTCAAATAGTCTTAAAGCGA
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AGATTAATACTTCATTTATGGGATTCAATATTAATAAATATTTTAAAAAATAAATCATGC
AGCTAATTTTTTGAGATAGTAAAACATTTAGAGTTTCAGAAATATTGCAACTAACTATAA
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CTTACAATAAGATTTTGAAAAAACATCAGATTTCTTTAATTAAAATTAACACATATAATT
AATTATAAAAGATATTTGCCAAATAGCAGATTAGTATCCTAAATATTCTTTAATTAAAGT
TTTAAAATAAAAGGGATATGATTGGGAAGATATTCAAATTATTAAATTACCACATCCAGA
GTAGTTCTTACCAATTAATTAGAATAAATATAACTTCTAGATTTATGATATTAAAAATGA
AAAATTACTTATTGATAAGGTTTTTGAATGCCAAAGAATCGAAGAGGCATATTTGGCTAT
CAAAGAATAAATCATTAACAACCCAATAAATTAATAGTCTTTATGA


>TTHERM_01216140(protein)
MDFSQFKDESSSESNFEEQDRVESFLKKNETILDYSSIDQIQQSFNSSDLAILQSIHNKI
GNQNSLLLKNIEIAQNPEGFNKNLNPGQKDVETKQIQKGEAIEDKQESLVSSQNQNKKVL
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