Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01216140

Standard Name

DCR1 (DiCeR 1 )

Aliases

PreTt28880 | 277.m00034 | 3823.m01226

Description

DCR1 type III restriction enzyme res subunit; Dicer-related RNase III protein; one of three Dicer-like proteins described in T. thermophila; RIG-I-like Receptor (RLR) Helicase

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF00636 ) Ribonuclease III domain
  • ( PF04851 ) Type III restriction enzyme, res subunit

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01928 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR1 with neo3 Macronucleus: Loss of part of DCR1 locus and of the neo3 used to KO.
  • ( SD01929 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR1 with neo3 Macronucleus: Loss of part of DCR1 locus and of the neo3 used to KO.
  • ( SD02158 ) Micronucleus: heterozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02177 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02178 ) Micronucleus: homozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02179 ) Micronucleus: heterozygous KO of DCR2 with neo3
  • ( SD02833 ) Micronucleus: Nee3 cassette into DCR1 locus
  • ( SD02834 ) Micronucleus: Nee3 cassette into DCR1 locus

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16357212: Lee SR, Collins K (2006) Two classes of endogenous small RNAs in Tetrahymena thermophila. Genes & development 20(1):28-33
  2. Ref:16199890: Malone CD, Anderson AM, Motl JA, Rexer CH, Chalker DL (2005) Germ line transcripts are processed by a Dicer-like protein that is essential for developmentally programmed genome rearrangements of Tetrahymena thermophila. Molecular and cellular biology 25(20):9151-64
  3. Ref:15598983: Mochizuki K, Gorovsky MA (2005) A Dicer-like protein in Tetrahymena has distinct functions in genome rearrangement, chromosome segregation, and meiotic prophase. Genes & development 19(1):77-89

Sequences 

>TTHERM_01216140(coding)
ATGGATTTCAGTCAGTTTAAAGACGAAAGTAGCTCTGAATCCAATTTTGAAGAATAAGAT
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CCAATAGTTTTCGACTGTTTAATTAATGAAAGAGGTTAGTATTTGTCTCTTATCATTTTA
CCTTTTCAACTCTAAGCAAATATTTTTATGAATCTCCAGAAGCTAAAATTTAAAAAAGAA
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TATGACAAGCAGTGTTTAGAAGGCTTTATCCATTAAGATATTAAATTTATCTTCCATAAC
TAAATTAATTTAAGCAATGAAGAATTAAACGAAATTAGAAAAATTAACCAATAAGCTCAT
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TTTTTAGGAAAGTAATATTTCAGATTTATAACCAGCATTAATGTTTTCAATGAAAACTTT
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TCTATCAATTACAAATTTAATAACATAGGTCTTCTCTAATAGGTATTTACTCATTCTTCA
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TTGAATGACTTCATCACCGAAATATAAAAAACAGAAAAAAGATAATCTTTTATACAGCTA
AATGATGTTTCAAATGATGTACTTTCATTTTTAGGATCTATAATATTCTCTCAAATAGTC
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GAAATAATATGTTGTGAATAAACAAAGTCTTTCTTGTCTGCAAAATTTAAATTAGATTAA
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CTTATTGATAAGGTTTTTGAATGCCAAAGAATCGAAGAGGCATATTTGGCTATCAAAGAA
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>TTHERM_01216140(gene)
TAAAATTTTTGTTGATTAATTTCTTGAGAAATAGGAAAATAGTAAGTAATAGGATAAATA
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ATGAATCTCCAGAAGCTAAAATTTAAAAAAGAAGATGCTTAAAGATGTGCTTTTATGCAG
GCAGTCAAGAGCCTATTAAAAAACAAATATATCTCAAATGAGCTAAGACCGAGACATAAA
TCTTACAAAAATTTCTATTTTGGAAGAGGTGAAGATGATTACTATGTTGAATACTCTGAT
AGATATTTTGCTATTATATAAAAGAACATGCAGGAAGTATTTGTAGGATATTTAAATGGA
AAAAAGAGATAAATTGTTGTCTACAAAAAACTTTATCGTTAAATTGTAGATGAAGTTTTT
GTTTAAAAAGAATAAATCTAATAAAGAGAATTTCATCCCTTTTATCTCTATGATATATAA
TACAAGGGTGAATTACTTTAAGTTAAACTTATTTATGACAAGCAGTGTTTAGAAGGCTTT
ATCCATTAAGATATTAAATTTATCTTCCATAACTAAATTAATTTAAGCAATGAAGAATTA
AACGAAATTAGAAAAATTAACCAATAAGCTCATTTAAAGTTATTAAATCTTGATAAAATG
AATCTTGAGCCTAAAAAAATTTACACTAGCAAATGTTTAATTTATAAAAAAACATAAATC
TTAGATTATAAAAACACAGAAGAAAGTGTGCTAATTAATGAAAATGTGGTTTTTCTTTAC
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GATTAAATTAGAGATTTTCTTAAACTTAAAATTATTTCTGAAAAAATATCAAAAAAACTT
AACTAAGAAATAATTGATTTTTAGAATATGCAAATAGAACAATTAAATGTTTTTATCAAG
CCAAATTTTAAGCTTACTGGTTCGCTCTCTAAATCAAATATTAAACAAGATTAGAAAGAA
ATTTATCCTCTTTAATTTGAGAATCTGTTAACCTTAACAGAAAGAGATTTAATCTAAATT
TTTTAGAAAAAATAATTAGAGAAAAACCTTGTGTTTTTAGGAAAGTAATATTTCAGATTT
ATAACCAGCATTAATGTTTTCAATGAAAACTTTAAAACACACTATGATATTTTAATAAGT
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TATAGTGTTTTAACCAAATTCGTAAATATCTAACCAGAATAGATTTAGTATAAACCTGAT
AAATAAAATTTATTAAATTAATTTAGCTAGAATTCTATCAATTACAAATTTAATAACATA
GGTCTTCTCTAATAGGTATTTACTCATTCTTCATATAAATAAGATATGGTTTGTTCAGAT
CTTAATAAGATCTTTGGAACTCTAGAAAAATCTTTGAATGACTTCATCACCGAAATATAA
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TTTTTAGGATCTATAATATTCTCTCAAATAGTCTTAAAGCGACTTTACACGAGATACAGT
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ATATAAATTTTATATTTCATAACATATTTCTTATTTTTATTTTGGAATTAAAATATTTAA
AAGGAATAAC



>TTHERM_01216140(protein)
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