Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01309130

Standard Name

MLL1 (Mixed lineage leukemia 1)

Aliases

PreTt09136 | 319.m00018

Description

MLL1 SET domain protein; SET domain containing protein; homolog to MLL proteins in mammals- Trithorax in Drosophila- and SET1 in yeasts.

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00097 ) Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
  • ( PF00130 ) Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)
  • ( PF00439 ) Bromodomain
  • ( PF00628 ) PHD-finger
  • ( PF00856 ) SET domain
  • ( PF02809 ) Ubiquitin interaction motif
  • ( PF03107 ) C1 domain
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
  • ( TIGR01560 ) uncharacterized phage protein (possible DNA
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20980.1 9.997093137033517e-262
Description: SET domain-containing protein (2325 aa)
WormBase WBGene00006439 9.997093137033517e-262
Description: locus:ant-1.1 status:Confirmed UniProt:O45865 protein_id:CAB04874.1
Oxytricha Contig20462.0.g58 7.002264059090237e-38
Description: PHD-finger
DictyBase DDB_G0289257 9.99648502569394e-38
Description: set1 on chromosome: 5 position 2551579 to 2556233
WormBase WBGene00004782 3.000842737734004e-34
Description: locus:set-2 Probable histone-lysine N-methyltransferase set-2 status:Partially_confirmed UniProt:Q18221 protein_id:CCD65735.1
Tetrahymena borealis EI9_20667.1 3.000842737734004e-34
Description: hypothetical protein (149 aa)
SGD YHR119W 1.000137892321693e-31
Description: SET1 Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex; COMPASS methylates histone H3K4; Set1p-dependent H3K4 trimethylation recruits Nrd1p, allowing efficient termination of snoRNAs and cryptic unstable transcripts (CUTs) by Nrd1p-Nab3p-Sen1p pathway; modulates histone acetylation levels in promoter proximal regions to ensure efficient Nrd1p-dependent termination; required in transcriptional silencing near telomeres and at silent mating type loci; has a SET domain
Stentor Coeruleus SteCoe_26223 0.000000000000001713908431542013
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences 

>TTHERM_01309130(coding)
ATGGATTAAAGAGATTAAATTCAGATTTCATTAAAGGACTACGCAGAGCTTATAGAAAAT
CGTAAAAGAGTACTAAGAAGTAATACTAACACTGGTAGCAGCAATCAGCAATAACCAGCT
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TGCTTTATGTGTGGGGCATTCGATGGTTATAAATCATTACTTTTTTGCACAAGCTGCTTC
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TGTAGTAAGGGTCCTAACATTACAAAGAATCTTTTTTGCAGAAAATGTGATGCTATGGTT
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TTCTTTTGCTATACATGCAAAGACTCAAATCAAAGTTACATGTAAAAGATTTATGAAAAT
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TAAAATACTATGGCTTATGACAAACTTTGTTAACAACTAAGAGATGAAGGAATTCTGATA
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GAGCAACTAAAAAATAAAAAATCATTTTGGAGAGACACATATATCTAATCCAATTAATTT
TATTATAAATCAGAATAAATTTATTCAATAGCTTACTTAGATTTGTATAAAAGAGGAATA
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TACAGATATGATGAAAATGGATAATTAGAAGTTATTTTTATTGAAAATGATAGAAGACAT
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ATTAGAGAAAGGGGACTATCAAATCAAAGCTCATCTTAAGCTATATAATTCCCTTCAAGA
GATGGATCTAATTAACCTATGGAAATAGAAGATAGTAACCAACCTAGTGAATAATTAATA
CCAATTGCACCTGTTAAATTATCTTAAAATAGATTTTAGCTTTCTCTCGTTTACTCTTCA
TACTTTAATCAAACAATACTTGACTTATAAATGAAAATTTAATAAGAAAATAGCCAATAT
TAAAAATGTTTTAAAACATATATTAACATTCCTATATTAGAAGAAAAGAGCACTGTTTAA
TTATCGACTGTTACTGGAATAAATAAAAGAAGGGATATTGCTTAGTGTATAATCTTATTG
CAAGCTTAAGAAGAATAACTTGTTGCTTCTGTTAGACAAATGCTTGATGAGTTTATGGAA
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AATTAATTCAGAGAAGCTTAGAAAAAATTAATTCTTGTTGATAATAATATAATCGATGAT
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AGATTTGGTTCTTTTATACTTGTCAATCTTGACACACAAGAAACAAATGATGATGAATTT
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TATGTTACTGCATTTTGGTTGAAAAAAAAGAAAGATGAATATATTTTAAAATCTTGTTTG
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TTTTCAATAGAAAAAGATAGACCATTCACTAATGAATTAAGTGCCAACATAAAAAATTTA
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TTTGCAAAAACTTACTTTAAATAAGACGATATTGTTGTTGAATATCTTGGTGAAACAATT
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TATATGTTCAAAGCATGCCCTGATAAAATTATTGATGCCACTTTTAAAGGGAATGAAGCC
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GATTCAAAAATCATAATTTATGCAAAGAGAGATATAAAACCTGGAGAGGAGCTTACATAT
GATTACTGCTTTGATATAGAAGAAGAGAAGATTAACTGTAACTGCAATGATCCTAATTGC
ACAAGAATAATGAATTGA


>TTHERM_01309130(gene)
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TTTTGCACAAGCTGCTTCGAATCTTATCATCCCTATTGCCTTATGATTCCAGGAAGATAA
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TTTTATAAAATTTATCTCCAGAATAGGGAATGGAACTGTCCTAAATGCTAGGTCTGCAAA
GTTTGTAGTAAGGGTCCTAACATTACAAAGAATCTTTTTTGCAGAAAATGTGATGCTATG
GTTCATTTTGAATGTGAATTTAAAGACGTTCAAGTATGGAATGAATCTAAAAATGAACTT
TACTGGTAGTGCTCAGATTGCTTTAATTGTGCCAAATGTTCGTCAAAATCTTTAATTGAT
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AAGTTTACCACAAAAAATGCTTTGAAAAAGCTTATCCAGAATATATTTAGTAGTTCTTTT
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AGCTAATAATAGAAAAGTAGGCTTAAACTTACAAACTAAACAGGAAAGACATAGGTGATT
TCATAGCAGAATATTTACATTATTTCGAAAGCGATTAAGTAAGCTCATTTTTGGAAAATT
ATGCAAATAATTAATTTTTTTAAAACTAGTTTGGTATTTATAAATAAAATACTATGGCTT
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GATCTAATTAACCTATGGAAATAGAAGATAGTAACCAACCTAGTGAATAATTAATACCAA
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AATTAATTAATTTTACTTTTACTATTTTAAGCGATTCATAAAAATAAAATAATATTTTTA
AATAGATGCAATATTTAAAATTGGTCAACAATTTTAACACAGATAGAAGAATTTTTATAT
CACTTACAAAATAAGAAGGAGGAAACATCGATTTTAGTGGAGAGTGCTATAATAGATTTG
GTTCTTTTATACTTGTCAATCTTGACACACAAGAAACAAATGATGATGAATTTTTCTCAT
CTTATTTCTTTATGAGATACATTAGACCTTTTGTTTCACAAAAATATCAGTCTTATGTAA
ATTTTTAAAATAAATTTTTTTAAAAACAAGGCTTATATTATTTATTTGAGTGCCTGCTTT
TAATTGATAGTAAATTTTATTATAAAATAAATAAATAAGGTTACTGCATTTTGGTTGAAA
AAAAAGAAAGATGAATATATTTTAAAATCTTGTTTGCTTGCAGAAACTAACAAAATATTT
TCATAGACAAAAAATATTGATGAAAACAAAAATGAATTTTCAATAGAAAAAGATAGACCA
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TCAAACAATAATATACCTAGATTTACTAACAATGTATTGAAAGATAAAGATATATTTAAT
CATGACCAACTTGATTGCTTCACTTCATTAAAAGGTATACAATAGCTCCTCTAAGAAAAG
ATAAATTAAATATACTAAAGATACAAGGGTGATTAACCTAATAAAAGTACTGATGTTAAC
AAATTTGTTATGGAATACATTGGTTTTGGTATTCCTCAAATAGTCAAAGCTTGCTAATAG
TCTTCAAAATAAAATAAAAATAACAATATATTCTAGAACATTTAAAATATCAAAGTAAAC
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