Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01337400

Standard Name

HPL2 (Heterochromatin Protein 1 Like 2)

Aliases

PreTt02558 | 333.m00018 | 3795.m00073 | TCD1 | JUB5

Description

HPL2 heterochromatin protein; Heterochromatin protein 1

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

  • obsolete signal peptidase I activity (IEA) | GO:0009004
  • PLC activating G protein-coupled glutamate receptor activity (IEA) | GO:0001639

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD02157 ) Macronucleus: HA2-CDH2
  • ( SD02610 )
  • ( SD02611 )
  • ( SD02759 ) Micronucleus: Neo3 replaces most of coding Macronucleus: Neo3 replaces most of coding
  • ( SD02760 ) Micronucleus: Neo3 replaces most of coding Macronucleus: Neo3 replaces most of coding

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_21098.1 6.002203762674495e-72
Description: heterochromatin protein 1 (727 aa)
DictyBase DDB_G0283023 0.0000000000019997478866288316
Description: hcpA on chromosome: 4 position 170065 to 170742
WormBase WBGene00001995 0.00000039992052383199455
Description: locus:hpl-1 status:Confirmed UniProt:G5EET5 protein_id:CAA94152.1
Oxytricha Contig19010.0.g64 0.000000600201742947405
Description: Chromo (CHRromatin Organisation MOdifier) domain

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
111 JUB1, COI16, JUB3, JUB2, JUB4, HPL2, COI3, COI6, JUB6 This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.

Associated Literature

  1. Ref:28692189: Wiley EA, Horrell S, Yoshino A, C Schornak C, Bagnani C, L Chalker D (2017) Diversification of HP1-like Chromo Domain Proteins in Tetrahymena thermophila. The Journal of eukaryotic microbiology ( ):
  2. Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
  3. Ref:25989344: Xu J, Yuan Y, Liang A, Wang W (2015) Chromodomain protein Tcd1 is required for macronuclear genome rearrangement and repair in Tetrahymena. Scientific reports 5( ):10243

Sequences 

>TTHERM_01337400(coding)
ATGTTAATTAAATTGAATTTCAGTTTAGTATTTATCACGCTAATTATTAGCTTAGTTATT
GTTTATATTAGCTAAACTCGTAAACTTAATAAATAAAAATTTTTCTTAATTAATTACATA
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>TTHERM_01337400(gene)
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TTTTCTATTGAACCTTGTGACTAATCTACTCTACAAGATCTTTCTAAGACTACTTTCAAA
GTTATGTGGAAACCAAGAGTTAATGGTTGTGTACCTCTACCAAGTCTAATATCTTACTAA
ATGCTAAAAGAACATGATCCAGTAGGCTTGGTTTTATTTTTTGAAAATCTAATATAGAAA
TAATAGTAATAAATAGCTAAATGA


>TTHERM_01337400(protein)
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